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2024 年度 実施状況報告書

疾病の原因となる生体高分子間相互作用の新たな拮抗メカニズムの解明と創薬戦略

研究課題

研究課題/領域番号 24K02169
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

大澤 匡範  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 教授 (60361606)

研究分担者 横川 真梨子  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 講師 (60648020)
石田 英子  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 助教 (70563295)
研究期間 (年度) 2024-04-01 – 2027-03-31
キーワードタンパク質-タンパク質相互作用 / 拮抗 / 競合 / 阻害
研究実績の概要

本研究では、「転写因子FOXO3aをめぐるDNAと14-3-3ζの拮抗メカニズムの解明」、「TDP-43の凝集・沈殿と、RNA結合によるその阻害のメカニズムの解明」を通じて、複合体の立体構造や解離定数だけからでは説明のつかない効率性の高い拮抗メカニズムを解明することを目的とする。また明らかにしたメカニズムに基づき、新規阻害剤をデザインし創薬につなげる。
【転写因子FOXO3aをめぐるDNAと14-3-3ζの拮抗メカニズムの解明】
(a)ITCによるリン酸化FOXO3aとDNAの相互作用、およびリン酸化FOXO3aと14-3-3ζの相互作用における解離定数(Kd)およびその他の相互作用に関する熱力学的パラメータを得た。(b)FSECによるリン酸化FOXO3aに対するDNAと14-3-3ζの拮抗関係の定量的解析を実施し、三者の相互作用を定量的に評価した。
【TDP-43の凝集・沈殿と、RNA結合によるその阻害のメカニズムの解明】
(a)沈殿形成能および核酸の沈殿形成抑制能の評価法を確立し、これまでにデザインした200種類の核酸の沈殿抑制活性を評価した。(b)ITCにより、デザインしたRNAとTDP-43のKdを算出した。(C)Kdと沈殿形成抑制能(IC50)との相関解析を行い、これらが正の相関を示した。これらのことから、高い沈殿抑制活性を有する核酸を獲得するには、TDP-43との高い結合親和性を有するものをデザインすればよいという創薬戦略が構築できた。この戦略に基づき、TDP-43の沈殿形成を抑制する高活性核酸を複数創出することに成功した。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

研究概要に記した成果は、当初の計画通りに実施し、予想外の結果を含め良好な結果が得られているため、おおむね順調に進んでいると結論した。

今後の研究の推進方策

今後も計画通り進める予定である。
【転写因子FOXO3aをめぐるDNAと14-3-3ζの拮抗メカニズムの解明】
(c)NMRによるリン酸化FOXO3a―14-3-3ζ複合体の立体構造解析、(d)DNAと14-3-3ζがFOXO3a上で「①直接競合する部位」と「②直接競合しない部位」の同定、特に、拮抗における14-3-3ζ結合の優位性のメカニズムの解明を目指す。
【TDP-43の凝集・沈殿と、RNA結合によるその阻害のメカニズムの解明】
(c)TDP-43の沈殿画分におけるTDP-43同士の相互作用部位の同定、(d)TDP-43のRRMへの核酸結合による、沈殿形成抑制機構の解明を目指す。

次年度使用額が生じた理由

当初、2024年度に更新予定の備品がまだ使用に耐えられるため、2025年度に購入することとした。また、解析に用いたタンパク質試料の調製が予定よりも円滑に行えたため、支出を抑えることができた。2025年度の研究計画では、試料調製がより困難であることが想定されるため、試料調製用の消耗品を購入する予定である。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2025 2024

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] NMR 1H, 13C, 15N backbone resonance assignments of 14-3-3ζ binding region of human FOXO3a (residues 1-284)2024

    • 著者名/発表者名
      Enomoto Shota、Nakatsuka Shoichi、Kuwayama Tomoya、Kawatsu Kosaku、Yokogawa Mariko、Osawa Masanori
    • 雑誌名

      Biomolecular NMR Assignments

      巻: 18 ページ: 275~283

    • DOI

      10.1007/s12104-024-10200-7

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ribonuclease inhibitor and angiogenin system regulates cell type-specific global translation2024

    • 著者名/発表者名
      Stillinovic Martina、Sarangdhar Mayuresh Anant、Andina Nicola、Tardivel Aubry、Greub Frederic、Bombaci Giuseppe、Ansermet Camille、Zatti Marco、Saha Dipanjali、Xiong Jieyu、Sagae Takeru、Yokogawa Mariko、Osawa Masanori、Heller Manfred、Keogh Adrian、Keller Irene、Angelillo-Scherrer Anne、Allam Ramanjaneyulu
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 10 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1126/sciadv.adl0320

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) 担持ビーズを用いた新型コロナウイルス感染症治療薬シードの探索2025

    • 著者名/発表者名
      江川 奏, 齋藤 駿, 山本 瑞生, 横川 真梨子, 大澤 匡範, 荻 貴之, 荒井 緑
    • 学会等名
      日本薬学会第145年会
  • [学会発表] INT-767の作用機序に基づいた胆汁酸誘導体による新規抗HBV薬の開発2024

    • 著者名/発表者名
      奥村彰規、荒井潤、池田和由、山下ユキコ、井口裕介、横川真梨子、梅澤一夫、宇根瑞穂、大澤匡範、伊藤清顕
    • 学会等名
      第110回日本消化器病学会総会
  • [学会発表] 14-3-3ζ Interacts with FOXO3a-DBD and Competitively Dissociates DNA through the Tethering Effects via Two Binding Motifs.2024

    • 著者名/発表者名
      Shota Enomoto, Tomoya Kuwayama, Shoichi Nakatsuka, Mariko Yokogawa, Kosaku Kawatsu, Risa Nakamura, Tomomi Kimura, Mikio Tanabe, Toshiya Senda, Jun Saitoh, Hideyuki Saya, Masanori Osawa
    • 学会等名
      The 30th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 国際学会
  • [学会発表] Discovery of the Middle-sized Compounds Inhibiting the SARS-CoV-2 Viral Entry, Using in Silico Approach and NMR Analysis.2024

    • 著者名/発表者名
      Mariko Yokogawa, Shunki Kaneichi, Mahoro Horiuchi ,Taiga Otake, Tomoki Yonezawa,Yugo Shimizu, Kazuyoshi Ikeda, Yuichiro Yamamoto, Shota Sakai , Yoshimi Shimizu, Kohji Noguchi, Masayoshi Fukasawa Mitsuhiko Ikura, Masanori Osawa
    • 学会等名
      The 30th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規Keap1-Nrf2タンパク質間相互作用阻害剤とKeap1結合の構造基盤2024

    • 著者名/発表者名
      小島行人,石田英子,原田彩佳,米澤朋起,清水祐吾,池田和由,横川真梨子,大澤匡範
    • 学会等名
      フィジカルファーマフォーラム2024
  • [学会発表] BTG2によるCaf1依存的ポリA分解の促進機構の解明2024

    • 著者名/発表者名
      片岡 奈緒,横川 真梨子, 石井 裕一郎, 城 えりか, 高嶋 大翔, 沢崎 綾一, 寒河江 彪流, 尾上 耕一, 星野 真一, 大澤 匡範
    • 学会等名
      フィジカルファーマフォーラム2024
  • [学会発表] Development of novel anti-HBV drugs based on AI technology using bile acid derivatives to inhibit HBV and NTCP bindin2024

    • 著者名/発表者名
      Okumura A., Ikeda K., Arai J., Muraki Y., Nishimura S., Inden N., Yokogawa M., Yamashita Y., Iguchi Y., Ohashi H., Watashi K., Wakita T., Une M., Osawa M., Ito K.
    • 学会等名
      International HBV Meeting 2024
    • 国際学会
  • [学会発表] Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) 担持ビーズを用いた新型コロナウイルス感染症治療薬シードの探索2024

    • 著者名/発表者名
      江川 奏, 齋藤 駿, 山本 瑞生, 横川 真梨子, 大澤 匡範, 荻 貴之, 荒井 緑
    • 学会等名
      第10回 食品薬学シンポジウム
  • [産業財産権] SARS-CoV-2のヒト細胞への侵入又は感染を阻害できる物質のスク リーニング方法2024

    • 発明者名
      大澤匡範、他6名
    • 権利者名
      大澤匡範、池田和由、清水祐吾、米澤朋起、横川真梨子、野口耕司
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2024-105598

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公開日: 2025-12-26  

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