研究課題
基盤研究(A)
自前で開発したレプリカ交換傘サンプル法（REUS）と呼ばれる拡張アンサンブル法に基づく、薬剤候補分子の蛋白質へのドッキングシミュレーション法を２段階にわたり改良し、独自の結合自由エネルギー計算法の開発に成功した。また、REUSに基づく薬剤候補分子のドッキングシミュレーションにより、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤のアイソザイム選択性が実験結果と良く一致することを示すと共に、その選択性が、結合した薬剤候補分子の周りの疎水性アミノ酸の立体構造の安定性の違いに起因することを示した。
生物物理学、計算化学、計算物理学
