研究課題
本研究の目的は、細胞核内に収納されたゲノムDNAでの相同組換えの分子機構を解明することである。真核生物の細胞核内に存在するゲノムDNAは高次に折り畳まれたクロマチン構造を形成している。しかし、その高次クロマチンでの相同組換え機構は未だ不明瞭であり、相同組換えを介したDNA損傷修復機構を理解するためには、高次クロマチンでの相同組換え反応機構を明らかにする必要がある。本研究では、再構成クロマチンを用いたin vitro組換え反応系によって、クロマチン基質上での相同組換え反応の分子機構を解析した。さらに、出芽酵母のミニクロモソームを利用したin vivoクロマチン解析を並行して行い、クロマチンにおける相同組換え反応機構を包括的に理解することを目指した。本年度は、再構成クロマチンを基質とした相同的対合反応のin vitro解析系により、リンカーヒストンH1を含む高次クロマチンでの相同組換え反応を解析した。その結果、高次クロマチン構造はRAD51およびRAD54により触媒される相同的対合反応に対して阻害的に働くことが明らかになった。さらに、その阻害効果はヒストンH1のシャペロンとして知られるNap1によって解消され、高次クロマチンでの相同組換え反応が促進することが明らかになった。並行して、イネのRAD51タンパク質の生化学的解析を行い、相同組換えの部分反応に関する知見を得た。さらに、出芽酵母のミニクロモソームを利用したin vivo解析を行うために、ヒト相同組換え因子であるRAD51、DMC1、RAD54の強制発現系を検討した。
1: 当初の計画以上に進展している
高次に折り畳まれたクロマチンでの相同組換え反応の分子機構を解明するために、本年度はリンカーヒストンH1を含む高次クロマチンでの相同組換え反応の分子機構を解明した。本研究成果は、クロマチン構造による相同組換えの制御機構に関する重要な発見の一つであり、本申請の重要課題である。さらに、イネ由来のRAD51タンパク質を用いた解析は、相同組換えの中心反応である相同的対合反応の分子機構の理解に重要な知見を与えた。以上のことから、これらの成果は当初の計画を大きく上回っており、本年度は計画以上に研究が進展したと言える。
本年度に確立した高次クロマチン再構成系による相同的対合反応の解析は、今後の研究を遂行する上で重要な基盤技術となる。ヒストンには多種のバリアントが存在し、それらヒストンバリアントが多様なクロマチン構造を形成することが知られている。しかし、それらのヒストンバリアントと相同組換え反応との関係は未だ不明である。さらに、リンカーヒストンH1にも多くのサブタイプが存在することが知られており、これらのH1サブタイプの、相同組換え反応への寄与は全く明らかになっていない。今後は、ヒストンバリアントやリンカーヒストンサブタイプにより形成される多様な高次クロマチン構造が相同組換えに及ぼす影響を、本年度に確立した再構成クロマチンによる相同的対合反応解析系を用いて明らかにする。
すべて 2015 2014 その他
すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (20件) 備考 (2件)
Biomol Concepts
巻: 6 ページ: 67-75
10.1515/bmc-2014-0035
Biochemistry
巻: 54 ページ: 1171-1179
10.1021/bi501307g
Genes Genet. Syst.
巻: 89 ページ: 169-179
10.1266/ggs.89.169.
PLoS ONE
巻: 9 ページ: e114752
10.1371/journal.pone.0114752
Methods
巻: 70 ページ: 119-126
10.1016/j.ymeth.2014.08.019
Prot. Exp. Purif.
巻: 103 ページ: 8-15
10.1016/j.pep.2014.08.012
Scientific Rep.
巻: 4 ページ: 4863
10.1038/srep04863
Cell Rep.
巻: 7 ページ: 1039-1047
10.1016/j.celrep.2014.04.005
http://www.eb.waseda.ac.jp/kurumizaka/
http://www.hino.meisei-u.ac.jp/chem/LBT/Shimizu01.html