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2016 年度 実績報告書

時間分解分子間相互作用検出システムの開発とタンパク質反応機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25288005
研究機関京都大学

研究代表者

寺嶋 正秀  京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00188674)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
キーワード分子間相互作用 / 拡散係数 / タンパク質 / 反応 / 時間分解
研究実績の概要

タンパク質間相互作用は、生体分子の機能メカニズムを明らかにするために、非常に重要である。ここでは、これまで申請者が開発してきた独創的な過渡回折格子(TG )測定法を、もっと一般的な手法へと拡張することを目指した。TG 法をストップドフローシステムと組み合わせる場合に、通常のストップドフローシステムでは、大量のタンパク質溶液が必要となり、応用が困難であることがわかった。そのため、使用する溶液量を格段に減らすためのサンプルセルの工夫を行った。マイクロ流路を用いた結果、数マイクロリットルの溶液で高速混合し、TG信号を取れることに成功した。また、高速でサンプルを流すためのフローシステムの構築も行い、数100ミリ秒で乱流を押さえることに成功した。
この装置を用いて光センサータンパク質フォトトロピンの酸変性過程の時間分解検出を行った。酸性溶液と混合して光励起で拡散係数変化を追跡することができた。最初の100ミリ秒以内に大きな変性過程があり、それから数秒の時間で徐々に変性していく2段階の過程を検出することに成功した。この過程で反応分子と生成分子の拡散係数に変化はなかったので、2状態的に変性すること、酸変性によって反応効率が落ちていることなどがわかった。また、分子間相互作用を検出するために、ATPとの混合によって誘起される時計タンパク質KaiCの会合反応を調べた。その結果、7秒程度の会合を検出することに成功した。光トリガーでない会合反応をTG法でとらえたのはこれが初めてである。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2016 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 2件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 8件、 謝辞記載あり 6件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 6件、 招待講演 3件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Time-Resolved Fluctuation during the Photochemical Reaction of a Photoreceptor Protein: Phototropin1LOV2-Linker2016

    • 著者名/発表者名
      K. Kuroi, F. Sato, Y. Nakasone, K. Zikihara, S. Tokutomi, M. Terazima
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 18 ページ: 6228-6238

    • DOI

      10.1039/c5cp07472j.

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Macromolecular crowding effect for photoreactions of LOV2 domains of Arabidopsis thaliana phototropin 12016

    • 著者名/発表者名
      T. Yoshitake, T. Toyooka, Y. Nakasone, K. Zikihara, S. Tokutomi, M. Terazima
    • 雑誌名

      J. Mol. Liq.

      巻: 217 ページ: 43-50

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.molliq.2015.08.030

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Photochemical reactions of the LOV and the LOV-linker domains of the blue light sensor protein YtvA2016

    • 著者名/発表者名
      S. Choi,, Y. Nakasone, K. J Hellingwerf, M. Terazima
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 55 ページ: 3107-3115

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.6b00263

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Anomalous pressure effects on the photoreaction of a light-sensor protein from Synechocystis, PixD (Slr1694), and the compressibility change of its intermediates2016

    • 著者名/発表者名
      T. Nakajima, K. Kuroi, Y. Nakasone, K. Okajima, M. Ikeuchi, S. Tokutomi, M. Terazima
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 18 ページ: 25915-25925

    • DOI

      10.1039/C6CP05091C

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Dynamics of Inter-DNA Chain Interaction of Photoresponsive DNA2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Nakasone, H. Ooi, Y. Kamiya, H. Asanuma, M. Terazima
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. (Communication)

      巻: 138 ページ: 9001-9004

    • DOI

      10.1021/jacs.6b02525

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Time-resolved Detection of Light-induced Dimerization of Monomeric Aureochrome-1 and Change in Affinity for DNA2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Akiyama, Y. Nakasone, Y. Nakatani, O. Hisatomi, M. Terazima
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 120 ページ: 7360-7370

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.6b05760

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Characterization of thylakoid membrane in filamentous cyanobacteria and green alga with dual-detector fluorescence lifetime imaging microscopy with a systematic change of incident laser power2016

    • 著者名/発表者名
      S. Nozue, A. Mukuno, Y. Tsuda, T. Shiina, M. Terazima, S. Kumazaki
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys

      巻: 1857 ページ: 46-59

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2015.10.003

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 圧力印加過渡回折格子法による反応中のタンパク質圧縮率の時間分解計測2016

    • 著者名/発表者名
      黒井邦巧, 寺嶋正秀
    • 雑誌名

      熱測定

      巻: 43 ページ: 66-71

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Time-resolved detection of the transient grating signal using stopped flow system2016

    • 著者名/発表者名
      S. Takaramoto, Y. Nakasone, M. Terazima
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [学会発表] Transient fluctuations during protein reactions detected by time-resolved thermodynamics2016

    • 著者名/発表者名
      M. Terazima
    • 学会等名
      9th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Science
    • 発表場所
      Gyeongju, Korea
    • 年月日
      2016-11-14 – 2016-11-16
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 圧力でタンパク質の揺らぎと反応を制御する:SyPixD2016

    • 著者名/発表者名
      中島翼, 黒井邦巧, 中曽根祐介, 岡島公司, 徳富哲, 寺嶋正秀
    • 学会等名
      溶液化学シンポジウム
    • 発表場所
      産総研
    • 年月日
      2016-11-09 – 2016-11-11
  • [学会発表] 光依存的なDNA結合タンパク質EL222の光刺激構造変化のダイナミクス2016

    • 著者名/発表者名
      高門輝, 中曽根祐介, 寺嶋正秀
    • 学会等名
      分子科学討論会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [学会発表] 赤色光センサータンパク質Cph1のpH依存的光反応2016

    • 著者名/発表者名
      武田公利, 寺嶋正秀
    • 学会等名
      分子科学討論会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2016-09-13 – 2016-09-15
  • [学会発表] Advanced light sensing natural proteins that can detect light intensity2016

    • 著者名/発表者名
      M. Terazima
    • 学会等名
      Asia Pacific Society for Materials Research
    • 発表場所
      Sun Moon Lake, Taiwan
    • 年月日
      2016-08-11 – 2016-08-14
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A biosensor to detect inter-protein interaction and domain-domain interaction2016

    • 著者名/発表者名
      M. Terazima
    • 学会等名
      International Conference on Small Science
    • 発表場所
      Prague, Czech Republic
    • 年月日
      2016-06-25 – 2016-06-29
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Time-resolved thermodynamics for short lived intermediate species during a photosensor protein2016

    • 著者名/発表者名
      M. Terazima
    • 学会等名
      11th International Workshop on Subsecond Thermophysics
    • 発表場所
      Krakow, Poland
    • 年月日
      2016-06-21 – 2016-06-24
    • 国際学会
  • [学会発表] Translational diffusion of transient intermediate species during protein reactions: Phototropin2016

    • 著者名/発表者名
      M. Terazima, K. Takeda, Y. Nakasone, K. Zikihara, S. Tokutomi
    • 学会等名
      3rd International Conference on Fluid Flow, Heat and Mass Transfer
    • 発表場所
      Ottawa, Canada
    • 年月日
      2016-05-02 – 2016-05-03
    • 国際学会
  • [学会発表] Protein photoreaction for sensing light intensity2016

    • 著者名/発表者名
      K. Kuroi, Y. Nakasone, K. Okajima, M. Ikeuchi, S. Tokutomi, M. Terazima
    • 学会等名
      26th IUPAC Symposium on Photochemistry 2016
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      2016-04-03 – 2016-04-08
    • 国際学会
  • [図書] 光と生命の事典2016

    • 著者名/発表者名
      寺嶋正秀 (分担執筆)
    • 総ページ数
      436 (356-357)
    • 出版者
      朝倉書店
  • [図書] Molecular Science of Fluctuations Toward Biological Functions2016

    • 著者名/発表者名
      M. Terazima, M. Kataoka, R. Ueoka
    • 総ページ数
      270 (1-28)
    • 出版者
      Springer
  • [図書] 物性科学センター誌2016

    • 著者名/発表者名
      中曽根祐介,寺嶋正秀
    • 総ページ数
      18 (3-11)
    • 出版者
      京都大学環境安全保健機構 物性科学センター
  • [備考] 京都大学大学院理学研究科化学専攻 光物理化学研究室

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/hikari/

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公開日: 2018-01-16  

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