| 研究課題/領域番号 |
25290070
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 一部基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
ゲノム医科学
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| 研究機関 | 東京医科歯科大学 |
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研究代表者 |
田中 博 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 非常勤講師 (60155158)
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| 研究分担者 |
田中 真二 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科分子腫瘍医学, 教授 (30253420)
森岡 勝樹 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (30351589)
茂櫛 薫 順天堂大学大学院医学系研究科ゲノム, 再生医療センター, 助教 (60569292)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | 上皮間葉転換 / がん転移 / 遺伝子発現プロファイル / Waddington地形 / ARACNe / がんパスウェイ |
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| 研究成果の概要 |
我々は本年度、主に2つの研究を行った。１つは、肝細胞がんでの主要29遺伝子のパスウェイを文献情報に基づいて作成し、肝細胞がんの患者の遺伝子発現情報と組み合わせて解析した。さらに、遺伝子機能分類(GO)を用いた部分ネットワークの解析を行い、治療における有効性部分ネットワークの確認を行った。2つ目は、昨年から継続している癌の浸潤・転移に関わる上皮間葉転換の解析を行うため、細胞株でのより詳細な時間間隔での時系列の遺伝子発現情報を測定し、非負値行列特異値分解により、4つの特徴的な成分を抽出することができた。各時期の主要転写因子を更に絞り込むことで、転移阻害剤の開発に繋がる成果が得られた。
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| 自由記述の分野 |
生命情報学 がんシステム生物学 システム分子医学
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