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2013 年度 実績報告書

光合成による光エネルギー変換:光駆動電子移動の分子制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25291033
研究種目

基盤研究(B)

研究機関名古屋大学

研究代表者

野口 巧  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60241246)

研究分担者 加藤 千尋  神奈川県産業技術センター, 化学技術部, 専門研究員 (50233804)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード光合成 / 赤外分光法 / 電子移動 / 光化学系II / 水分解
研究概要

光化学系IIにおける電子伝達コファクターの酸化還元電位制御(Em)のメカニズムの解明を目指し、第一キノン電子受容体QAおよび第二キノン電子受容体QBの電位制御機構の研究を行った。QA,QBは、いずれもプラストキノン-9(PQ-9)より成り、それらはヒスチジンと非ヘム鉄を介して相互作用している。QAはQBよりも80 mV程低いEmを持つことにより、QAからQBへのスムースな電子移動が実現される。本研究では、光誘起フーリエ変換赤外(FTIR)差スペクトル法による分光解析および密度汎関数法(DFT)を用いた量子化学計算によって、QA及びQBが異なるEmを持つしくみを明らかにした。まず、PQ-9のモデル化合物としてPQ-1を用い、水分子を水素結合供与体とする様々な水素結合複合体モデルについてDFT計算を行い、水素結合数とEmの相関を調べた。その結果、カルボニル基への水素結合数とEmには線形関係があり、1水素結合あたり100-200 mVのEm上昇があることが示された。この関係はアミノ酸モデルを水素結合供与体として用いた複合体の計算においても成立していた。一方、これらのモデルの基準振動解析により、水素結合構造の対称性および水素結合数と中性PQのCO伸縮振動の振動数との間に一定の相関があることが示された。また、セミキノンアニオンの最も強いCO振動バンドの振動数は水素結合構造の影響をあまり受けないが、水素結合するアミノ酸の振動とのカップリングにより特徴的なサイドバンドが現れることが示された。これらの結果を実測のQAおよびQBの光誘起FTIR差スペクトルに適応することにより、QAは対称的な2つの水素結合を持つのに対し、QBは非対称的な3つの水素結合を持つことが明らかとなった。この水素結合数の違いがQAおよびQBのEm値の違いの主原因であることが示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初予定していたキノン電子受容体の酸化還元電子制御のしくみについて、フーリエ変換赤外測定と量子化学計算による重要な結果を得た。

今後の研究の推進方策

キノン電子受容体QAおよびQBの酸化還元電位制御の機構解明をさらに推し進めるため、それらの中間に位置し、QAからQBへの電子移動経路を形成する非ヘム鉄中心について、その酸化還元電位の制御機構を明らかにする。そのため、光誘起フーリエ変換赤外(FTIR)差スペクトル法と分光電気化学計測を組み合わせた手法を用い、水分解マンガンクラスターとの長距離相互作用による電位制御機構について調べる。また、光化学系IIの電子供与体側に位置し、マンガンクラスターの直接的な電子受容体として働くチロシンYZについて、その水素結合構造、および電子・プロトン移動反応を光誘起FTIR法と量子化学計算を用いて実験、理論の両面から詳細に調べ、YZとマンガンクラスター間のプロトン共役電子移動反応の分子機構を明らかにする。

次年度の研究費の使用計画

2014年3月でのWindowsXPのサポート終了に伴い、4月の年度初めにコンピュータおよびソフトの購入が必要であったため。
年度初めに研究室内のWindowsXPコンピュータ(Winodw7コンピュータへ)およびソフトの更新を行う。その他は主に実験のための物品費と旅費に充てる。

  • 研究成果

    (31件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (25件) (うち招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Development of a novel cryogenic microscope with numerical aperture of 0.9 and its application to photosynthesis research2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Shibata, W. Katoh, T. Chiba, K. Namie, N. Ohnishi, J. Minagawa, H. Nakanishi, T. Noguchi, H. Fukumura
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta

      巻: 1837 ページ: 880-887

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2014.03.006

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of hydrogen bonding interactions on the redox potential and molecular vibrations of plastoquinone as studied by density functional theory calculations2014

    • 著者名/発表者名
      R. Ashizawa and T. Noguchi
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1039/C3CP54742F

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of the basic amino acid residues on the PsbP protein involved in the electrostatic interaction with photosystem II2014

    • 著者名/発表者名
      T. Nishimura, C. Uno, K. Ido, R. Nagao, T. Noguchi, F. Sato, K. Ifuku
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2013.12.012

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional roles of D2-Lys317 and the interacting chloride ion in the water oxidation reaction of photosystem II as revealed by Fourier transform infrared analysis2013

    • 著者名/発表者名
      H. Suzuki, J. Yu, T. Kobayashi, H. Nakanishi, P. Nixon, T. Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 52 ページ: 4748-4757

    • DOI

      10.1021/bi301699h

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural coupling of extrinsic proteins with the oxygen evolving center in red algal photosystem II as revealed by light-induced FTIR difference spectroscopy2013

    • 著者名/発表者名
      C. Uno, R. Nagao, H. Suzuki, T. Tomo, and T. Noguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 52 ページ: 5705-5707

    • DOI

      10.1021/bi4009787

    • 査読あり
  • [学会発表] 光合成光化学系IIにおけるMnクラスターの損傷が非ヘム鉄の酸化還元電位に及ぼす影響2014

    • 著者名/発表者名
      加藤祐樹、野口巧
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      20140327-20140330
  • [学会発表] シアノバクテリアの光化学系IIにおける表在性蛋白質と水分解中心との相互作用2014

    • 著者名/発表者名
      長尾遼、中西華代、鞆達也、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      20140318-20140320
  • [学会発表] 光化学系IIにおいてMn除去は非ヘム鉄の酸化還元電位を変動させるか?2014

    • 著者名/発表者名
      加藤祐樹、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      20140318-20140320
  • [学会発表] 光化学系IIにおけるチロシンYzの水素結合構造とプロトン移動2014

    • 著者名/発表者名
      中村伸、長尾遼、高橋亮太、野口巧
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      20140318-20140320
  • [学会発表] 高等植物の光化学系II膜表在性サブユニットの結合様式2014

    • 著者名/発表者名
      西村太志、宇野千尋、井戸邦夫、長尾遼、深尾陽一郎、野口巧、佐藤文彦、伊福健太郎
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      20140318-20140320
  • [学会発表] Dedicated comparison of light-harvesting dynamics between the cyanobacterial and the higher plant photosystem II2014

    • 著者名/発表者名
      Ahmed Ali, Yutaka Shibata, Ryo Nagao, Takumi Noguchi, Hiroshi Fukumura
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      20140318-20140320
  • [学会発表] Development of a novel cryogenic microscope and its application to the fluorescence spectroscopy of single photosystem I complexes2014

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Namie, Wataru Katoh, Hanayo Nakanishi, Takumi Noguchi, Hiroshi Fukumura, and Yutaka Shibata
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      20140318-20140320
  • [学会発表] 光合成水分解反応の赤外分光解析2013

    • 著者名/発表者名
      野口巧
    • 学会等名
      物性研究所短期研究会
    • 発表場所
      物性研
    • 年月日
      20131111-20131113
    • 招待講演
  • [学会発表] FTIR-spectroelectrochemical investigation into whether Mn-depletion influences the redox potential of the non-heme iron in photosystem II2013

    • 著者名/発表者名
      Yuki Kato, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      20131028-20131030
  • [学会発表] FTIR study on the functions of extrinsic proteins in cyanobacterial photosystem II: Evolutionary aspect of extrinsic proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nagao, Hanayo Ueoka-Nakanishi, Chihiro Uno, Tatsuya Tomo, and Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      20131028-20131030
  • [学会発表] FTIR evidence for the presence of a strong H-bond with high proton polarizability between the YZ radical and a His in photosystem II2013

    • 著者名/発表者名
      Shin Nakamura, Ryo Nagao, Hanayo Ueoka-Nakanishi, Ryouta Takahashi, Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      20131028-20131030
  • [学会発表] FTIR study on the role of a chloride ion in photosynthetic water oxidation2013

    • 著者名/発表者名
      Takumi Noguchi, Hiroyuki Suzuki, Jianfeng Yu, Takashi Kobayashi, Hanayo Nakanishi, and Peter J. Nixon
    • 学会等名
      7th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy
    • 発表場所
      Kobe, Japan
    • 年月日
      20130825-20130830
  • [学会発表] FTIR-Spectroelectrochemical Study on the Influence of the Mn-depletion from photosystem II on the redox potential of the non-heme iron2013

    • 著者名/発表者名
      Yuki Kato and Takumi Noguchi
    • 学会等名
      7th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy
    • 発表場所
      Kobe, Japan
    • 年月日
      20130825-20130830
  • [学会発表] Site-specific structural modification around the special pair of homodimeric photosynthetic reaction center in green sulfur bacteria2013

    • 著者名/発表者名
      Chihiro Azai, Yuko Sano, Yuki Kato, Takumi Noguchi, Hirozo Oh-oka
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • 年月日
      20130811-20130816
  • [学会発表] Influence of Mn-depletion on the redox potential of the non-heme iron in photosystem II as revealed by FTIR-spectroelectrochemistry2013

    • 著者名/発表者名
      Yuki Kato and Takumi Noguchi
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • 年月日
      20130811-20130816
  • [学会発表] FTIR study on the interactions of the extrinsic proteins with the water-oxidizing center in cyanobacterial photosystem II: Evolutionary aspect of the functions of the extrinsic proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nagao, Hanayo Ueoka-Nakanishi, Chihiro Uno, Tatsuya Tomo, and Takumi Noguchi
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • 年月日
      20130811-20130816
  • [学会発表] Light-harvesting dynamics in photosystem II: a combination of time-resolved fluorescence spectroscopy and microscopic theory2013

    • 著者名/発表者名
      Yutaka Shibata, Ahmed Ibrahim Ali Mohamed, Shunsuke Nishi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Ryo Nagao, Takumi Noguchi, Hiroshi Fukumura, Thomas Renger
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • 年月日
      20130811-20130816
  • [学会発表] 光合成酸素発生系における表在性蛋白質とCl-結合部位の相互作用:NO3-置換による赤外分光解析2013

    • 著者名/発表者名
      近藤淳平、野口巧
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      20130531-20130601
  • [学会発表] 天然の光合成タンパク質と金ナノ粒子を用いた人工光合成ナノデバイスの開発2013

    • 著者名/発表者名
      河原弘典, 井上名津子, 加藤祐樹, 中西華代, 鞆達也, 菓子野康浩, 野口巧
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      20130531-20130601
  • [学会発表] 光化学系IIにおけるMn除去が非ヘム鉄の酸化還元電位に及ぼす影響 -FTIR-分光電気化学法によるアプローチ2013

    • 著者名/発表者名
      加藤祐樹、野口巧
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      20130531-20130601
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌の一次電子供与体P840の酸化還元差スペクトルの帰属再検討2013

    • 著者名/発表者名
      浅井智広、佐野裕子、加藤祐樹、野口巧、大岡宏造
    • 学会等名
      日本光合成学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      20130531-20130601
  • [学会発表] Mechanism of photosynthetic water oxidation as studied by flash-induced FTIR difference and time-resolved IR spectroscopies2013

    • 著者名/発表者名
      Takumi Noguchi
    • 学会等名
      The XVIth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • 発表場所
      Beppu, Oita, Japan
    • 年月日
      20130519-20130524
    • 招待講演
  • [学会発表] FTIR study of photosynthetic water oxidation and application to artificial photosynthesis

    • 著者名/発表者名
      Takumi Noguchi
    • 学会等名
      日本分光学会国際シンポジウム「分光学の太陽電池・天然/人工光合成への応用」
    • 発表場所
      大阪大
    • 招待講演
  • [学会発表] 光化学系II水分解中心と表在性蛋白質との相互作用:FTIR法による解析

    • 著者名/発表者名
      長尾遼、中西華代、鞆達也、野口巧
    • 学会等名
      生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      岡崎
  • [学会発表] 光化学系IIにおけるMnクラスターの損傷がアクセプター側機能分子に及ぼす影響 -FTIR分光電気化学計測による解析

    • 著者名/発表者名
      加藤祐樹、野口巧
    • 学会等名
      生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      岡崎
  • [備考] 名古屋大学理学研究科光生体エネルギー研究室ホームページ

    • URL

      http://www.glab.phys.nagoya-u.ac.jp/

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公開日: 2015-05-28  

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