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2015 年度 研究成果報告書

分子シミュレーションによるV型ATPaseの回転機構の解明

研究課題

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研究課題/領域番号 25291036
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

池口 満徳  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (60261955)

連携研究者 村田 武士  千葉大学, 理学研究科, 教授 (80415322)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワードV型ATPase / 分子動力学 / マルチスケールシミュレーション / 分子モーター
研究成果の概要

ATP加水分解のエネルギーを利用してイオンを運ぶ分子モーターであるV型ATPaseについて、分子動力学(MD)シミュレーションを用いた回転機構の研究を行った。水素まで考慮する全原子モデルと、アミノ酸を粒子と考える粗視化モデルの両方を用いたマルチスケールMDシミュレーションによって、軸回転の再現に成功し、その構造変化の解析から、どのようにV型ATPaseが回転しているのか、そのメカニズムを明らかにした。

自由記述の分野

生物物理学

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公開日: 2017-05-10  

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