| 研究課題/領域番号 |
25292204
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| 研究機関 | 独立行政法人農業生物資源研究所 |
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研究代表者 |
安河内 祐二 国立研究開発法人農業生物資源研究所, 昆虫ゲノム研究ユニット, 主任研究員 (50355723)
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| 研究分担者 |
佐原 健 岩手大学, 農学部, 教授 (30241368)
石川 幸男 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (60125987)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | 食性 / 嗅覚受容体 / アワノメイガ / 種分化 / 性フェロモン |
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| 研究実績の概要 |
圃場にアワノメイガのイネ科以外の食草であるショウガを栽培し、幼虫や蛹を採集して個別にゲノムDNAを調製した。また年次変化を調査するため26年度と同様にトウモロコシからも採集したほか、ゴボウからもアワノメイガ属幼虫を採集してゲノムDNAを調製し、フェロモン受容体遺伝子構造に種間や種内に相違があるかを検討した。その結果、アワノメイガにおいてOR3遺伝子が重複してOR1遺伝子に挿入したことによりOR1遺伝子が不活化されると考えられる変異を見出した。今後、食性の違いと嗅覚受容体遺伝子における変異との関連性をアンプリコンシーケンシングにより検索する予定である。
既に構造を決定したフェロモン受容体サブファミリーを除く45種のアワノメイガ触角で発現している既知遺伝子のうち42種を含むフォスミドクローンのDNAを混合してHiSeq2000で解析した。得られたスキャフォールド配列のギャップを埋めるためサンガー法によるシーケンシングを行い、既知遺伝子に加え14種の新規嗅覚受容体遺伝子を見出し、既知遺伝子を含めてその遺伝子構造を決定した。これらの一部は同一転写方向の遺伝子２~５個からなる11個のクラスターを形成していた。連鎖解析や隣接する遺伝子のカイコオルソログから約90%の遺伝子の座乗染色体を推定することができた。
ヨーロッパアワノメイガとウスジロキノメイガについても、BAC・フォスミドライブラリーから嗅覚受容体遺伝子を含むクローンの単離を行い、ヨーロッパアワノメイガについては27個、ウスジロキノメイガについては6個のクローンについてHiSeq2000による塩基配列決定を行った。今後、両種についても概要ゲノム塩基配列を決定することにより、種特異的な遺伝子を含めた比較を行い食性との関連を明らかにする予定である。
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| 現在までの達成度 (段落) |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 次年度使用額の使用計画 |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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