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2014 年度 実績報告書

メチル化シグナルによる長鎖非コードRNA機能の発現機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25293073
研究機関埼玉医科大学

研究代表者

黒川 理樹  埼玉医科大学, 医学部, 教授 (70170107)

研究分担者 藤本 健太  埼玉医科大学, 医学部, 助教 (50403580)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード酵素 / 遺伝子 / 核酸 / 生体分子 / 発現制御
研究実績の概要

平成26年度の研究計画は以下の様に設定した。
(1)次世代シークエンサーによるアルギニンメチル化TLS結合性lncRNAの探索
(A)TLSに結合するRNA画分を再確認する。(B)昨年度に同定されたlncRNA結合を増強するメチル化TLSと結合するRNA画分を解析する。
(2)メチル化シグナルによるlncRNA機能の発現機構の解析 (藤本,松下,黒川)
(A)(1)で得られたHAT阻害効果を持つlncRNAが高親和性を有するメチル化TLSを特定する。(B)特定のメチル化状態を生じるPRMT5と補助因子の条件を決め、lncRNA機能の発現を見る。
本研究課題の基盤になるNature論文(2008)では、我々が初めて同定したTLS結合性lncRNAであるcyclin D1プロモーター由来RNA(pncRNA-D)の発現は放射線照射による刺激で誘導されることを報告した。この放射線照射の操作は、煩雑なので代替法を模索してきた。本年度は、ソルビトールによる低浸透圧処理が、放射線照射にかわる処理として確立しつつある状況である。この処理法により、(1-A)および(1-B)を再検討している。やはり、本課題の基盤となるTLSのメチル化を再現性良く検出する方法の開発に取り組んだ。TLS‐アルギニンR216・R218に着目して、これらの残基を対称および非対称メチル化した場合に、それぞれの異性体を認識できるモノクローナル抗体の作成に挑戦した。その結果、非対称メチル化R216・R218を認識するモノクローナル抗体の作成に成功した。さらに、平成27年度は対称メチル化を認識するモノクローナル抗体の作成を進めている。これらの抗体を用いて、(A)および(B)を進めていく。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の研究実施予定の主目的は変えずに若干内容を変更して進めた。その結果、本課題の基本的問題点が解決でき、新たな展開が望める状況になった。このことから、概ね順調に進展してると判断された。

今後の研究の推進方策

平成26年度は、本研究の大きな課題であったpncRNA-Dの発現誘導処理の改善と、TLSのメチル化アルギニン検出法の構築に大きな進歩がもたらされた。当初の予定を、少し変更する事にはなったが、この2件が成就された意義はたいへん大きい。さらに、pncRNA-Dの結合部位解析を進め、NMRによる構造データも蓄積しつつある。本年度の進捗が期待される。

次年度使用額が生じた理由

予定していた高額の受託解析を延期したため。

次年度使用額の使用計画

抗体等の試薬類の購入と、受託解析費として使用予定である。

備考

埼玉医科大学ゲノム医学研究センター http://www.saitama-med.ac.jp/genome/
埼玉医科大学ゲノム医学研究センター遺伝子構造機能部門 http://www.saitama-med.ac.jp/genome/Div01_GSF/index.html

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] 巨大転写因子(MegaTrans)複合体によるエンハンサーの活性化2015

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: Vol.33 ページ: 54-55

  • [雑誌論文] poly(A)鎖が翻訳効率を上げるのは胚発生初期のみだった2014

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: Vol.32 ページ: 1751-1753

  • [雑誌論文] Development of a mouse monoclonal antibody for the detection of asymmetric dimethylarginine of Translocated in LipoSarcoma/FUsed in Sarcoma and its application in analyzing methylated TLS.2014

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, K., and Kurokawa, R.
    • 雑誌名

      Cell & Bioscience

      巻: 4 ページ: 77

    • DOI

      10.1186/2045-3701-4-77

    • 査読あり
  • [学会発表] Transcriptional regulation by the long non-coding RNA transcribed from cyclin D1 promoter via protein arginine methylation of RNA-biding protein TLS.2014

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, K., Suzuki, S., Kurokawa, R.
    • 学会等名
      IIAS Research Conference 2014 Chromatin Decoding
    • 発表場所
      京都府木津川市(国際高等研究所)
    • 年月日
      2014-05-13 – 2014-05-13
  • [学会発表] Long noncoding RNAによる遺伝子発現制御2014

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 学会等名
      第51回日本臨床分子医学会学術集会シンポジウム
    • 発表場所
      東京都千代田区(東京国際フォーラム)
    • 年月日
      2014-04-11 – 2014-04-11

URL: 

公開日: 2016-06-01  

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