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2015 年度 実績報告書

半導体シーケンサーによる口腔フローラの網羅的解析結果と健康との関連性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25293428
研究機関九州大学

研究代表者

山下 喜久  九州大学, 歯学研究科(研究院), 教授 (20192403)

研究分担者 江島 伸興  大分大学, 医学部, 教授 (20203630)
古田 美智子  九州大学, 歯学研究科(研究院), 助教 (20509591)
竹下 徹  九州大学, 歯学研究科(研究院), 准教授 (50546471)
清原 裕  九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80161602)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード口腔フローラ / 網羅的解析 / 16S rRNA遺伝子 / 次世代シーケンサー / 分子疫学
研究実績の概要

本年度は平成19年に採取した2343名の住民の唾液中の細菌構成と口腔の健康に関わる要因との関連の分析の最終確認を行い論文に纏めた。具体的には日本人の唾液マイクロバイオームのうち優占種の大半はどの住民にも共通しておりそれらが群集において大きな構成割合を占めること、構成比率の小さい菌種が多種検出される被験者ほど現在歯数が多いのに加えう蝕や歯周病など現在の口腔の健康状態が悪化していることが統計的にも確認された。さらに被験者に共通してみられる優占種はその共存関係から2グループに分類され、Neisseria flavescens、Porphyromonas pasteri、Haemophilus parainfluenzaeなどの菌種の構成比率が高く、Prevotella histicola、Prevotella melaninogenica、Veillonella parvulaなどの構成比率が低い被験者では年齢が若く肥満のものが少なくう蝕経験の少ないものが多く喫煙者も少ないことも明らかとなった。本結果は学術誌への投稿を行い掲載に至った。さらに平成24年に採取した唾液検体については次世代シーケンサーIon PGMを用いた16S rRNA遺伝子解析および品質が問題ないシーケンスリードの選出を完了した。平成19年および24年に行った健康診査で得られた各被験者の口腔および全身の健康状態に関するデータを整理し、唾液マイクロバイオームの経時的変化を検討するデータセットの準備を進めた。完成したデータセットを用いた解析は基盤研究(A)に繰り上げ申請して採択された「 宿主免疫を累加した分子疫学的アプローチによる口腔マイクロバイオームの病原性解明」の課題により実施する。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額が生じた理由

27年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額の使用計画

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (8件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Bacterial diversity in saliva and oral health-related conditions: the Hisayama Study2016

    • 著者名/発表者名
      Takeshita T, Kageyama S, Furuta M, Tsuboi H, Takeuchi K, Shibata Y, Shimazaki Y, Akifusa S, Ninomiya T, Kiyohara Y, Yamashita Y
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 ページ: 22164

    • DOI

      10.1038/srep22164

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 口腔常在微生物叢の構成と健康との関連2016

    • 著者名/発表者名
      竹下徹、山下喜久
    • 雑誌名

      日本乳酸菌学会誌

      巻: 27 ページ: 3-9

  • [雑誌論文] 誤嚥性肺炎予防における口腔ケアの有効性2015

    • 著者名/発表者名
      古田美智子、山下喜久
    • 雑誌名

      臨床と研究

      巻: 92 ページ: 1575-1580

  • [雑誌論文] 口腔マイクロバイオーム2015

    • 著者名/発表者名
      山下喜久、竹下徹
    • 雑誌名

      臨床と微生物

      巻: 42 ページ: 711-715

  • [雑誌論文] 口腔マイクロバイオーム評価の臨床的意義2015

    • 著者名/発表者名
      山下喜久、竹下徹
    • 雑誌名

      臨床化学

      巻: 44 ページ: 290-297

  • [学会発表] 歯科からみた呼吸器感染症2016

    • 著者名/発表者名
      山下喜久
    • 学会等名
      第46回日本嫌気性菌感染症学会
    • 発表場所
      長崎大学医学部良順会館、長崎市
    • 年月日
      2016-03-04 – 2016-03-05
  • [学会発表] Ion PGMシステムを用いた大規模メタ16S解析による健康に関わる口腔マイクロバイオームの探索2015

    • 著者名/発表者名
      竹下徹
    • 学会等名
      Applied Biosystems /Ion Torrent ユーザーグループミーティング2015
    • 発表場所
      品川シーズンテラスカンファレンス、東京
    • 年月日
      2015-12-11
  • [学会発表] 疾患および健康に関連する口腔常在マイクロバイオームの探索2015

    • 著者名/発表者名
      竹下徹
    • 学会等名
      日本乳酸菌学会秋季セミナー
    • 発表場所
      昭和女子大学大講堂、東京
    • 年月日
      2015-11-27
  • [学会発表] ADLの低下した無歯顎高齢者の口腔マイクロバイオーム2015

    • 著者名/発表者名
      影山伸哉、竹内研時、泉繭依、我那覇生純、竹下徹、柴田幸江、古田美智子、山下嘉久
    • 学会等名
      第9回細菌学若手コロッセウム
    • 発表場所
      レインボー桜島、鹿児島市
    • 年月日
      2015-11-23 – 2015-11-25
  • [学会発表] Salivary microbiome and environmental conditions in the oral cavity2015

    • 著者名/発表者名
      Takeshita T, Yamashita Y
    • 学会等名
      第63回国際歯科研究学会JADR
    • 発表場所
      福岡国際会議場、福岡市
    • 年月日
      2015-10-31
  • [学会発表] A Molecular epidemiology study exploring oral microbiome structure associated with human health2015

    • 著者名/発表者名
      Takeshita T, Yamashita Y
    • 学会等名
      歯科基礎医学会サテライトシンポジウム
    • 発表場所
      朱鷺メッセ、新潟市
    • 年月日
      2015-09-11
  • [学会発表] 歯の有無が口腔常在細菌叢に与える影響2015

    • 著者名/発表者名
      影山伸哉、竹内研時、泉繭依、我那覇生純、竹下徹、柴田幸江、古田美智子、山下嘉久
    • 学会等名
      第37回九州口腔衛生学会・総会
    • 発表場所
      長崎県歯科医師会館、長崎市
    • 年月日
      2015-09-06
  • [学会発表] 生活機能の低下が口腔常在細菌叢に与える影響2015

    • 著者名/発表者名
      影山伸哉、竹内研時、泉繭依、我那覇生純、竹下徹、柴田幸江、古田美智子、山下嘉久
    • 学会等名
      第64回日本口腔衛生学会・総会
    • 発表場所
      つくば国際会議場、つくば市
    • 年月日
      2015-05-27 – 2015-05-29
  • [図書] ヒトマイクロバイオーム研究最前線2016

    • 著者名/発表者名
      山下喜久、竹下徹
    • 総ページ数
      472
    • 出版者
      株式会社エヌ・ティー・エス

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公開日: 2017-01-06  

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