| 研究課題/領域番号 |
25304016
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 応募区分 | 海外学術 |
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| 研究機関 | 東北大学 |
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研究代表者 |
河田 雅圭 東北大学, 生命科学研究科, 教授 (90204734)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | ニッチ進化 / 高温適応 / アノールトカゲ |
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| 研究概要 |
本年度、9月にキューバ南東部を調査し、高温乾燥適応集団(A. homolechis)、森林帯集団(A. homolechis)、沿岸部乾燥地帯集団(A. jubar)の捕獲採集を行った。また、高温乾燥地帯、高温乾燥地帯でのデーターロガーの回収と新たな設置を行った。沿岸部の調査により、A.homolechisおよびA. jubarが側所的に分布をしていることが明らかになった。捕獲した個体は、ハバナ大学で飼育するほか、日本およびキューバでの許可後、10月に東北大学に輸入した。また、その他の組織サンプルは9月に許可の上、持ち帰った。持ち帰った組織サンプルを用い、予備的にミトコンドリアおよび核DNAでの配列を決定したところ、東南部の高温適応集団、森林集団のA. homolechisおよび沿岸部のA. jubarはほとんど違いが見られなかった。今後、ゲノムワイドな大量のSNPを次世代シークエンアーを用いて検出する予定である。
さらに高温適応種の温度耐性をみるために、温度、湿度を変えた飼育環境下での行動をビデオ録画し、行動解析を行うための実験準備が完成し、予備データを得ることができた。26年度は、本格的に行動データを取る予定である。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
予定どおりサンプル採集、飼育、輸入、環境データの収集が行え、次年度の行動実験およびゲノム解析の準備が整った。
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| 今後の研究の推進方策 |
今後は、環境データをとると同時に、高温適応している別の集団の調査を実施する。
さらに大量のSNPを得るために、マイクロサテライト領域を挟んだ領域を増幅し、次世代シークエンサーによって配列を解読するMIG-seqを行う。これにより、A. homolechisとA. jubarの雑種形成度合いと適応に関する遺伝子の検出を行う。
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| 次年度の研究費の使用計画 |
次世代シークエンサーによるRAD-seq解析をする予定であったが、条件検討によりRAD-seqではなくMIG-seq解析を次年度を実施することにしたため。
次世代シークエンサーを用いたMIG-seq解析を行う。
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