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2015 年度 実績報告書

スケルトン並列プログラミング手法による高速・大規模脳情報処理の実現

研究課題

研究課題/領域番号 25330088
研究機関高知工科大学

研究代表者

松崎 公紀  高知工科大学, 工学部, 准教授 (30401243)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワードソフトウェア / fMRI / 超解像 / 並列化
研究実績の概要

脳神経科学の研究・臨床においてMRI/fMRI (functional MRI) が広く用いられているが,特にfMRI画像では解像度が小さいことが課題である.そこで,本年度は,MRI画像/fMRI画像に対する超解像処理を主なターゲットとして,それらの処理の実現ならびに並列化を含む高速化の適用を行った.具体的には,3点の方法でそれらの高速化に取り組み,以下の成果を得た.
1) GPUを用いた並列処理の適用による高速化:事前に作成した超解像処理プログラムをC++言語に移植し,さらにOpenCLを用いてGPU向けに並列化を行った.その結果,逐次のC++版のコードに比べて約3倍の高速化が達成された.
2) C++言語による逐次プログラム部分の高速化:C++による既存プログラムそのものに対して,プログラム最適化手法を適用することにより並列化を用いずに達成できる高速化を行った.特に,コンパイラによる最適化がききやすいコードへ修正することにより,約3倍の高速化が達成できた.
3) Haskell言語とそのライブラリによる並列化:関数型言語HaskellとそのライブラリRepa/Accelerateを用いることにより,超解像処理プログラムを比較的容易に実現できることを示した.また,ライブラリRepaを用いることで,容易に並列効果が得られることも示した.
以上の成果はそれぞれ独立にfMRI画像に対する超解像処理を高速化するものであるが,1) と 2) を組み合わせることにより,より高速な処理が実現できることが期待される.

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Functional Models of Hadoop MapReduce with Application to Scan2016

    • 著者名/発表者名
      Kiminori Matsuzaki
    • 雑誌名

      International Journal of Parallel Programming

      巻: (online) ページ: (online)

    • DOI

      10.1007/s10766-016-0414-9

    • 査読あり
  • [学会発表] プログラム高速化の効果の検証 -超解像処理を題材として2016

    • 著者名/発表者名
      畑中 涼, 松崎 公紀
    • 学会等名
      第18回プログラミングおよびプログラミング言語ワークショップ(PPL2016)
    • 発表場所
      岡山県
    • 年月日
      2016-03-07 – 2016-03-09
  • [学会発表] MR画像に対する超解像化とその高速化に関する検討2016

    • 著者名/発表者名
      松崎 公紀
    • 学会等名
      医用画像情報学会平成27年度春季(第174回)大会
    • 発表場所
      広島県
    • 年月日
      2016-02-06 – 2016-02-06
  • [学会発表] MRI Image Processing with OpenCL2015

    • 著者名/発表者名
      Juan Luis Soler Ferrer, Kiminori Matsuzaki
    • 学会等名
      第32回日本ソフトウェア科学会大会
    • 発表場所
      東京都
    • 年月日
      2015-09-08 – 2015-09-11

URL: 

公開日: 2017-01-06  

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