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2014 年度 実施状況報告書

設計金属タンパク質の機能化の研究

研究課題

研究課題/領域番号 25410174
研究機関名古屋工業大学

研究代表者

田中 俊樹  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70171775)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード銅イオン / ブルー銅タンパク質 / デノボ設計タンパク質 / ヘリカルバンドルタンパク質 / 安定性
研究実績の概要

昨年度に、設計したブルー銅タンパク質の疎水場のアミノ酸を変位させることで、酸化還元電位の調節を行った。今年度は、このタンパク質を基にレッド銅タンパク質の設計を行った。天然のレッド銅タンパクは、ブルー銅タンパク質の銅イオンにさらに水が配位し、タイプII型の銅イオンの配置となる。そのような配置を考えたが赤色でなく黄色を呈した。そこで、2つのCys残基が配位した天然タンパク質を参考に、Cys残基を種々の場所に加えた。その内の一つが赤色を呈した。このタンパク質について詳細を調べた。EPR、EXAFSなどの物理科学的分析から、このタンパク質はタイプ1.5型の構造であることが示唆された。これまでに天然タンパク質では見つかっていない新規な銅イオンの配位構造を有している。酸化還元電位を測定するために、種々の測定方法を試したが、まだ信頼できる値は得られていない。
非常に安定なタンパク質を作製する目的で、昨年度に3本鎖へリックスバンドルタンパク質のループ部分にジスルフィド結合を導入したタンパク質を作製した。このタンパク質は50%エタノール溶液でも三次構造が保たれていることがわかった。そこでルテニウムの結合実験を行ったが、まだ結合の確認にはいたっていない。今年度はさらに、4本鎖へリックスバンドルタンパク質についても試みた。ジスルフィド結合はへリックス間に入れた。コンピューターでモデル構造を作製し、適切と思われる位置にシステインを導入した。このタンパク質が実際にジスルフィド結合ができているのを確認した。本タンパク質を用いて、ブルー銅タンパク質にする予定である。この事で、銅イオンの配位を安定化し、以前に問題があった退色を遅くする効果が期待できる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ブルー銅タンパク質を基に、レッド銅タンパク質に銅イオンの配位構造を変える事ができた。この酸化還元電位の測定に工夫を行ったが、まだ正確な値が得られていない。また、タンパク質の安定化において、ジスルフィド結合を適切な位置に導入し、この操作により、50%エタノール溶液でも立体構造を保つことのできるタンパク質を作製できた。しかし、ルテニウムの配位を試みたが、まだ'ルテニウムの結合を確認できていない。

今後の研究の推進方策

昨年度で達成できなかった、酸化還元電位の測定を行う。安定なヘリカルバンドル型タンパク質の改良を行いながら、銅やルテニウムなどの金属イオンの結合実験を行う。
ブルー銅タンパク質から、二つの銅イオンを持つタイプIII型の配位構造を持つタンパク質の設計、構築を行う。

次年度使用額が生じた理由

今年度は、装置の大きな修理が発生しなかったため、大学からの基盤経費を研究に用いることができた。これまでに作製したタンパク質は不安定であったため、EPR、酸化還元電位などの測定の条件設定に時間がかかった。そのため、予定していた変異体が作製、また構造解析用のタンパク質が作製できずに費用が残った。

次年度使用額の使用計画

今年度に、安定なタンパク質の作製に成功している。このタンパク質を大量に作製し構造解析に利用する。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2014

すべて 学会発表 (7件) (うち招待講演 1件)

  • [学会発表] システインを利用した安定なコイルドコイルタンパク質の設計と評価2014

    • 著者名/発表者名
      柘植大志、田中 俊樹
    • 学会等名
      第2回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-12-02
  • [学会発表] 安定な平行型3本鎖コイルドコイルの設計2014

    • 著者名/発表者名
      岩田晋明、田中 俊樹
    • 学会等名
      第2回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-12-02
  • [学会発表] Type3銅含有タンパク質の人工設計2014

    • 著者名/発表者名
      北原知恵、田中 俊樹
    • 学会等名
      第2回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-12-02
  • [学会発表] Creation of various copper configurations in the four helical bundle protein.2014

    • 著者名/発表者名
      Toshiki Tanaka
    • 学会等名
      Workshop on Artificial photosynthesis: Engineering of light-harvesting processes based on Peptide and Protein Science.
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-10-06
    • 招待講演
  • [学会発表] ルテニウム結合de novo タンパク質の作製と評価2014

    • 著者名/発表者名
      柘植 大志、田中 俊樹
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム2014
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2014-09-12 – 2014-09-13
  • [学会発表] de novo設計したレッド銅タンパク質の構造解析2014

    • 著者名/発表者名
      亀井美里、志賀大悟、田嶋邦彦、菊地晶裕、鷹野優、中村春木、田中俊樹
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
  • [学会発表] 4-へリックスバンドルタンパク質中へ一時的な銅-Cys結合を利用したタイプ3銅イオンサイトのde novo設計2014

    • 著者名/発表者名
      安部雅人、志賀大悟、鷹野優、中村春木、田中俊樹
    • 学会等名
      第24回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-06-14 – 2014-06-15

URL: 

公開日: 2016-05-27  

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