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2015 年度 実績報告書

1つの細胞が持つ新奇なウイルス防御システムの体系的理解

研究課題

研究課題/領域番号 25440013
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

新海 暁男  国立研究開発法人理化学研究所, 横山構造生物学研究室, 先任研究員 (10391989)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワードCRISPR-Cas / 獲得免疫 / 超分子複合体 / 電子顕微鏡構造 / タンパク質 / 低分子RNA / リボヌクレアーゼ / Thermus thermophilus
研究実績の概要

CRISPR-Casシステムは細菌特有の獲得免疫システムで、ウイルス(ファージ)由来のDNAやRNAなど、細胞外から侵入してくる核酸を分解する。本システムはCRISPRと呼ばれる特徴的な塩基配列を持つDNA領域とCRISPRの近傍にコードされているタンパク質群から構成されている。本システムの作用機構を解明することは、獲得免疫システムの原型やその進化を考察するために重要である。本研究はゲノムが比較的小さいにも関わらず比較的多種類のCRISPR-Casシステムを持つThermus thermophilus株をモデル生物として用い、1つの細胞におけるCRISPR-Casシステムを体系的に理解することを目的としている。今年度は、本菌株のCRISPR-Casシステムを構成しているCmr、Csm両複合体、および、CRISPRの近傍にコードされている機能未知タンパク質群のX線結晶構造解析を行うことを目的として、これらのタンパク質の発現・調製を試みた。その結果、Cmr複合体を構成している6種類のタンパク質サブユニットのうちの4種類を大腸菌無細胞タンパク質合成法で同時に発現させることによってCmrサブ複合体を作製することができた。このサブ複合体に、大腸菌で発現させた2種類のタンパク質サブユニット、および、34~46塩基のRNAを混合することによって、Cmr複合体を作製することができた。Csm複合体を構成している5種類のタンパク質サブユニットは、いずれも大腸菌あるいは大腸菌無細胞タンパク質合成法で発現した。しかし、それらのうちの1種類は何れの発現系においても不溶性であった。4種類の機能未知タンパク質:TTHB159、-158、-157、-156のうち、TTHB156以外のものは大腸菌あるいは大腸菌無細胞タンパク質合成法で発現した。しかし、TTHB158タンパク質は不溶性であった。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [国際共同研究] Wageningen University/University of Utrecht(オランダ)

    • 国名
      オランダ
    • 外国機関名
      Wageningen University/University of Utrecht
  • [国際共同研究] University of California, Berkeley(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      University of California, Berkeley
  • [雑誌論文] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Cmr複合体の構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 87 ページ: 454-458

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2015.870454

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilusのType III CRISPR-Casシステムを構成しているリボヌクレオタンパク質複合体の構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 学会等名
      BMB2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、兵庫県神戸市
    • 年月日
      2015-12-03
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Casシステムを構成するCmr複合体の構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 学会等名
      第17回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌、北海道札幌市
    • 年月日
      2015-07-15

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公開日: 2017-01-06   更新日: 2022-01-27  

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