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2016 年度 実績報告書

時分割X線および中性子解析によるシトクロムb5還元酵素の触媒機構の全容解明

研究課題

研究課題/領域番号 25440037
研究機関国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構

研究代表者

玉田 太郎  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子応用研究所 東海量子ビーム応用研究センター, 上席研究員(定常) (50391248)

研究分担者 平野 優  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子応用研究所 東海量子ビーム応用研究センター, 研究員(定常) (80710772)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
キーワード酸化還元酵素 / 高分解能X線結晶構造解析 / 中性子結晶構造解析
研究実績の概要

NADHシトクロムb5還元酵素(b5R)は酸化還元酵素の1つであり、生体内において不飽和脂肪酸の合成、薬物代謝、コレステロールの合成、赤血球の維持などに関与している。b5Rが触媒する酸化還元サイクルにおいて、b5Rは電子供与体であるNADHから電子を2つ受け取り、2つあるドメインの境界に存在する補因子(FAD)を介して、電子受容体であるシトクロムb5(b5)に1つずつ電子を伝えることが分光学的手法により明らかにされているが、原子レベルでの詳細な理解は進んでいない。本申請研究は、中性子およびX線結晶構造解析法と分光学的手法を組み合わせることによりb5Rの構造-機能相関を明らかにし、これまで断片的な理解に留まっていた酸化還元酵素の触媒機構の全容を全原子レベルで解明することを目的としている。
平成28年度は、過年度に取得したb5R酸化型の高分解能(0.78Å)X線回折データに対し、多極子解析を適応することで、通常の解析では知ることができない外殻電子分布を含む詳細な構造情報を明らかにした。外殻電子分布情報およびそれに基づくFADとタンパク質間の相互作用様式を中心に原著論文としてまとめ、国際誌(Scientific Reports誌)に投稿、受理、掲載された。また、b5R酸化型の中性子構造解析については、過年度にパルス中性子源J-PARCで取得した1.40Å分解能回折データの処理の再検討を実施し、統計値を大幅に改善することに成功した。さらに、研究用原子炉(ドイツFRM-II)由来の単色中性子を用いた良質な1.45Å分解能回折データ収集にも成功した。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Distribution of valence electrons of the flavin cofactor in NADH-cytochrome b5 reductase2017

    • 著者名/発表者名
      Takaba, K., Takeda, K., Kosugi, M., Tamada, T. and Miki, K.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 ページ: 43162

    • DOI

      10.1038/srep43162

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Neutron Protein Crystallography in Japan2017

    • 著者名/発表者名
      Tamada, T.
    • 学会等名
      Neutron Biology for Next Generation
    • 発表場所
      Tokai, Japan
    • 年月日
      2017-03-22 – 2017-03-23
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] High-resolution crystal structures of the heme-binding domain of cytochrome b5 from porcine liver2016

    • 著者名/発表者名
      Hirano, Y., Kimura, S. and Tamada, T.
    • 学会等名
      5th International Symposium on Diffraction Structural Biology (ISDSB2016)
    • 発表場所
      ノックスビル(米国)
    • 年月日
      2016-08-07 – 2016-08-10
    • 国際学会
  • [学会発表] High-resolution neutron crystal structural studies of electron transfer proteins2016

    • 著者名/発表者名
      Tamada, T.
    • 学会等名
      IPR International Symposium, 2016 Taiwan-Japan Joint Symposium of Crystallography
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 年月日
      2016-06-23 – 2016-06-24
    • 国際学会
  • [学会発表] ブタ肝臓由来シトクロムb5ヘム結合ドメインの高分解能結晶構造2016

    • 著者名/発表者名
      平野 優、木村 成伸、玉田 太郎
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2016-06-07 – 2016-06-09

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公開日: 2018-01-16  

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