| 研究課題/領域番号 |
25450016
|
|---|
| 研究機関 | 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
|---|
研究代表者 |
田口 和憲 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 北海道農業研究センター・畑作基盤研究領域, 主任研究員 (80414754)
|
|---|
| 研究分担者 |
岩田 洋佳 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授 (00355489)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
|
| キーワード | 他殖性 / 連鎖不平衡 / テンサイ / ゲノミックセレクション |
|---|
| 研究実績の概要 |
平成２６年度は、４つの高ヘテロ集団（糖分循環選抜1群、糖分循環選抜２群、無選抜増殖１群、無選抜増殖２群）からなる合計３００個体の遺伝子型調査を進めた。なお、糖分循環選抜１群、糖分循環選抜２群は、平成２５年度に個体別にSachs le docte法に基づいて個体別に糖分分析を行ったものである。これら４集団の遺伝子型データは、Taqman法によるSNPマーカー53種類、およびテンサイのエリート育種集団において視認性と識別性が優れたCAPSマーカー35種類の合計88種類を用いて取得した。ゲノミックセレクションの解析ソフトについては、岩田らが開発を進めてきたgsWizardのプロトタイプ版をコンピューター上でデモデータを用いて各線形回帰モデルに基いた計算を行い、正常に動作したことを確認した。
|
| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
解析に必要な表現型データと遺伝子型データを計画通りに取得できた。遺伝解析ソフトウェアも予定通りに作成され、正常な動作を確認した。
|
| 今後の研究の推進方策 |
平成２７年度は、当初計画通りに２種類の高ヘテロ集団について糖分選抜および無選抜の集団間の遺伝子型を比較し、糖分選抜の有無とマーカー遺伝子型のアソシエーションについて調査する。加えて、平成２５年に個体別に糖分分析して評価したデータに基いて、ゲノミックセレクションによる高速育種の可能性を検討する。得られた知見、解析結果については、学会発表ならびに論文公表を積極的に進める予定である。
|
| 次年度使用額が生じた理由 |
平成２６年１０月から長期在外研究のため米国（ウィスコンシン大学）の客員研究員として海外へ滞在することになったため。
|
| 次年度使用額の使用計画 |
帰国後には、すみやかに成果の取りまとめを行い、共同研究者とともに発表ならびに論文執筆を進める。
|
