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2015 年度 実績報告書

放線菌二次代謝制御因子の解析および多面発現制御による生合成プラットフォームの構築

研究課題

研究課題/領域番号 25450155
研究機関広島大学

研究代表者

荒川 賢治  広島大学, 先端物質科学研究科, 准教授 (80346527)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード放線菌 / アゾキシアルケン / 生合成 / 線状ゲノム / 制御遺伝子 / ポリケチド
研究実績の概要

(1) 線状レプリコンの塩基配列解析に基づいたゲノム構造に関する研究
IlluminaおよびPacBio次世代シークエンサーによるS. rochei染色体の塩基配列解析を行い、全長が8.36 Mbであること、さらに二次代謝生合成遺伝子クラスターは33個存在していることを明らかにした。また、ゲノムの線状構造維持におけるプラスミドの関与を明らかにした。
(2) 制御遺伝子破壊株から取得したアゾキシアルケン化合物の生合成起源
我々は「シグナル分子制御系」「主要二次代謝生合成」の人為的改変により三重変異株を取得し、この株からアゾキシアルケン化合物KA57-Aを獲得した。本化合物 KA57-A ([M+Na]+=239) は特徴的な構造を有しており、アゾ結合の形成機構や生合成起源など興味深い点が多い。
そこで標識化合物の取り込み実験による生合成起源の探索を行った。標識酢酸の取り込み実験により、cis-1-ヘキセニル基 (C1'-C6') は脂肪酸由来であり、C-1位は酢酸の2位炭素由来であることが示唆された。一方、C2-C4 位はアラニン由来と考えられたが、[3-13C]アラニンのC-4位への取り込みが認められなかった。そこで[2,3,3-2H3]DL-serineを添加したところ、KA57-AのH-4位にのみ重水素の取り込みが認められた。また[1,1-D2]1-hexylamineを添加し、常法に従って精製したところ、KA57-Aの他に分離困難な夾雑物が認められ([M+Na]+=243)、分子式はC10H20D2N2O3と示唆された。これは[1',1'-2H2]1',2'-dihydro-KA57-Aに相当しており、2H-NMRにおける後者の高磁場シグナルは本化合物に対応すると考えられる。重水素標識ヘキシルアミン添加時の夾雑物の蓄積は、KA57-A生合成における1',2'-不飽和化がアゾキシ結合形成後に生じることを意味している。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] ワイズマン研究所(イスラエル)

    • 国名
      イスラエル
    • 外国機関名
      ワイズマン研究所
  • [国際共同研究] University of Alberta(カナダ)

    • 国名
      カナダ
    • 外国機関名
      University of Alberta
  • [雑誌論文] 放線菌のシグナル分子制御系改変による休眠二次代謝の誘導2016

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 74 ページ: 40-42

  • [雑誌論文] Blockage of the early step of lankacidin biosynthesis caused a large production of pentamycin, citreodiol, and epi-citreodiol in Streptomyces rochei2015

    • 著者名/発表者名
      Zhisheng Cao, Ryuhei Yoshida, Haruyasu Kinashi, Kenji Arakawa
    • 雑誌名

      J. Antibiot.

      巻: 68 ページ: 328-333

    • DOI

      10.1038/ja.2014.160

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Isolation and biosynthesis of an azoxyalkene compound produced by a multiple gene disruptant of Streptomyces rochei2015

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Kunitake, Takahiro Hiramatsu, Haruyasu Kinashi, Kenji Arakawa
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 16 ページ: 2237-2243

    • DOI

      10.1002/cbic.201500393

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiの遺伝子変異株における二次代謝産物プロファイルの解析2016

    • 著者名/発表者名
      勝賀瀬 夏実,Yosi NINDITA,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] ランカサイジン生合成における補酵素ピロロキノリンキノンの機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      梅代 亜紗子,山内 佑介,薮内 優,鈴木 敏弘,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] Secondary metabolites production of plasmidless mutants of Streptomyces rochei 7434AN42016

    • 著者名/発表者名
      Yosi NINDITA,稲田 晋宣,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiの多重変異株が生産するアゾキシアルケン型化合物の生合成機構の解析2016

    • 著者名/発表者名
      岸本 拓也,國武 博文,Yosi NINDITA,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rochei変異株で見出された抗カビ化合物ペンタマイシンとシトレオジオールの生合成遺伝子の解析2016

    • 著者名/発表者名
      山手 直貴,片岡 憂祐,Yosi NINDITA,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] ミズクラゲ幼生の内在性変態制御物質の探索2016

    • 著者名/発表者名
      中谷 みなみ,辻田 菜摘,吉岡 沙弥香,小山 寛喜,荒川 賢治,国吉 久人
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] ミズクラゲ幼生の変態に対するリソソーム酵素の関与2016

    • 著者名/発表者名
      辻田 菜摘,吉岡 沙弥香,小山 寛喜,荒川 賢治,国吉 久人
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(札幌)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [学会発表] ミズクラゲ幼生に対する変態調節物質の構造活性相関2015

    • 著者名/発表者名
      黒田 理絵,辻田 菜摘,中谷 みなみ,小路 淳,荒川 賢治,国吉 久人
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会 合同大会(神戸)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] ミズクラゲ幼生の変態に伴って発現上昇するリソソーム酵素遺伝子aspartylglucosaminidaseの解析2015

    • 著者名/発表者名
      辻田 菜摘,桑原 宏行,今井 つかさ,矢中 規之,小路 淳,荒川 賢治,国吉 久人
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会 合同大会(神戸)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] 抗生物質生産におけるピロロキノリンキノン要求性酵素の生化学的諸性質2015

    • 著者名/発表者名
      山内 佑介,薮内 優,鈴木 敏弘,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      第67回日本生物工学会大会(鹿児島)
    • 発表場所
      鹿児島・城山観光ホテル
    • 年月日
      2015-10-26 – 2015-10-28
  • [学会発表] 放線菌二次代謝生合成・制御遺伝子の分子基盤解析および有用物質発酵生産への応用2015

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 学会等名
      2015年度発酵と代謝研究奨励賞
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2015-10-14
    • 招待講演
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rochei変異株が生産するアゾキシアルケンの生合成機構2015

    • 著者名/発表者名
      國武 博文,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      第30回日本放線菌学会大会(富山)
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2015-09-07 – 2015-09-08
  • [学会発表] Streptomyces rochei 7434AN4株の線状ゲノムの全塩基配列決定2015

    • 著者名/発表者名
      稲田 晋宣,Yosi NINDITA,曹 志生,田上 道平,Alexander LEZHAVA,志波 優,吉川 博文,石川 淳,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      第30回日本放線菌学会大会(富山)
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2015-09-07 – 2015-09-08
  • [学会発表] Phenotypic properties of the plasmidless mutants of Streptomyces rochei 7434AN42015

    • 著者名/発表者名
      Yosi NINDITA,稲田 晋宣1,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      第30回日本放線菌学会大会(富山)
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2015-09-07 – 2015-09-08
  • [学会発表] 抗生物質生産における補酵素ピロロキノリンキノンの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      梅代 亜紗子,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      第30回日本放線菌学会大会(富山)
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2015-09-07 – 2015-09-08
  • [学会発表] Streptomyces rochei 遺伝子変異株における二次代謝産物プロファイルの解析2015

    • 著者名/発表者名
      勝賀瀬 夏実,Yosi NINDITA,木梨 陽康,荒川 賢治
    • 学会等名
      第30回日本放線菌学会大会(富山)
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2015-09-07 – 2015-09-08
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/index.html

URL: 

公開日: 2017-01-06  

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