| 研究課題/領域番号 |
25450241
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
鈴木 史朗 京都大学, 生存圏研究所, 助教 (70437268)
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| 研究分担者 |
梅澤 俊明 京都大学, 生存圏研究所, 教授 (80151926)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | リグニン / モノリグノール / アシル化 / バイオリファイナリー |
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| 研究概要 |
ポプラのマイクロアレイデータ解析およびBAHDアシル基転移酵素ファミリーの系統樹解析により、モノリグノールのアシル化に関わると推定される酵素遺伝子を網羅的に探索した。その結果、モノリグノールのp-ヒドロキシベンゾイル化酵素の候補遺伝子を２種類見出した。
ノルリグナンの一種、cis-ヒノキレジノールの生合成前駆体は、モノリグノールの一種のp-クマリルアルコールがp-クマロイル化されて生成するp-クマル酸p-クマリルである。従って、cis-ヒノキレジノールを産生するエリシター処理済アスパラガス培養細胞においては、p-クマル酸p-クマリルが生成しており、その生合成に関わる酵素であるモノリグノールのp-クマロイル化酵素が発現していると推測される。そこで、エリシター処理済および未処理のアスパラガス培養細胞のRNA-seq解析をそれぞれ行い、エリシター処理により遺伝子発現が増加するp-クマロイル化酵素遺伝子の候補を５種類見出した。続いて、５種類の全長遺伝子をクローニングし、大腸菌を用いて組換え酵素の発現を試みた。その結果、３種類の候補遺伝子については、相当する組換え酵素が大腸菌破砕液の可溶性画分に見出された。
アスパラガス培養細胞のRNA-seq解析から得られた仮想遺伝子配列（コンティグ）を相同性検索に供し、ケイヒ酸／モノリグノール生合成経路上の酵素遺伝子を網羅的に見出した。続いて、エリシター処理済および未処理細胞におけるそれぞれの遺伝子の発現量を計算し、代謝経路上にマッピングした。その結果、エリシター処理によってcis-ヒノキレジノール生合成に関わると推測されるケイヒ酸／モノリグノール生合成経路上の酵素遺伝子の発現量が顕著に増加したことが見出された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
1: 当初の計画以上に進展している
理由
H25年度に予定していた研究内容（遺伝子発現解析実験）の他に、H26年度に予定していた研究内容の一部（候補遺伝子のcDNAクローニングおよび組換え酵素発現）を実施することが出来たため。
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| 今後の研究の推進方策 |
アスパラガス由来のモノリグノールのp-クマロイル化酵素に関しては、５種類の候補遺伝子のうち、３種類については、大腸菌破砕液の可溶性画分に相当する組換えタンパク質が発現していることが見出された。そこで、今後、これらの組換えタンパク質を精製し、酵素アッセイに供する。また、組換えタンパク質が得られていない２種類の酵素については、ベクターや宿主を変更し、組換え酵素の発現を試みる。一方、ポプラ由来のモノリグノールのp-ヒドロキシベンゾイル化酵素に関しては、ポプラのゲノム配列に基づき、遺伝子合成によりcDNAを取得し、組換え酵素の発現を試みるとともに、基質および酵素反応生成物標品を有機合成する。
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