| 研究概要 |
本研究では、インフルエンザウイルスHAと亜型間交差反応性抗体の立体構造を基に、計算科学的手法を用いて、HAと抗体との分子間相互作用を解析する。さらに本研究では、既知のHA-抗体複合体構造を鋳型に遺伝子を改変して、抗体の親和性と特異性を操作し、多くのHAを認識する抗体の設計を試みる。
本年度は、当研究室で作出された亜型間交差反応性抗体S139/1とH1, H2, H3, H6および H13亜型のHAとの分子間相互作用を分子動力学シミュレーションにより解析し、亜型間共通エピトープおよびパラトープの構造的特徴を調べた。
シミュレーションの初期構造であるHA-抗体複合体の構築には、構造重ね合わせ、ホモロジーモデリング、ドッキングシミュレーション等の分子モデリング手法を組み合わせ、検討した。その結果、ホモロジーモデリングのみで構築した構造を初期構造としたシミュレーションから得られた結合自由エネルギーが、実験値と定性的によく一致した。また、コンピュータ上で行った変異導入シミュレーションの結果も、定性的に実験値と一致した。以上の結果から、本研究におけるシミュレーション方法の妥当性を確認することが出来た。
つづいて、残基S139/1に中和されるHA亜型（H2,H3,H16）の相互作用残基を同定し、亜型間共通のエピトープを決定した。また、同様に亜型間交差反応に重要なS139/1上のアミノ酸を同定した。本年度の成果に基づき、来年度以降、「より多くのHAに結合し得る抗体の設計」および「交差反応性抗体からエスケープする際に見られるHA上のアミノ酸置換の特徴の解明」を試みる。
|
