エピゲノム改変を基点としたブタ有用形質発現とヒト生活習慣病病態の総合理解

2015 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 25450472
• 研究機関: 明治大学
• 研究代表者: 大鐘 潤 明治大学, 農学部, 准教授 (50313078)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: エピジェネティクス / エピゲノム改変 / 非コード(nc）RNA / 食肉形質 / 生活習慣病

研究実績の概要

平成27年度は、前年度に確立したアリルごとのDNAメチル化状態に着目したウルトラディープバイサルファイトシーケンスについて、バイオインフォマティクス解析および有用性の検証を脳下垂体組織について行い、原著論文として発表した。また、筋細胞の増殖、分化に重要なMstn遺伝子について、前年度までに発見した組織特異的メチル化状態およびmRNAの発現パターンと相関または逆相関する長鎖遺伝子間非コード（linc）RNAを発見し、lincRNAの詳細な発現パターンを検討した。さらに、Mstn遺伝子座のlincRNAの機能を解析するために、lincRNA発現ベクターおよびlincRNAノックダウン用のshRNA発現ベクターの作製を終了した。これをもとにブタ胎仔線維芽細胞や脂肪前駆細胞に導入し、DNAメチル化状態およびmRNA発現状態を検討するための基礎を構築した。以上より、骨格筋、脂肪細胞分化および個体の成長に重要なホルモンの産生組織である脳下垂体でのDNAメチル化解析法の確立およびエピジェネティック制御に関するncRNAの探索系を確立し、エピゲノム改変によるブタ有用形質発現およびそれに類似した現象と考えられるヒト生活習慣病態研究のための基盤構築を終了した。

研究成果

• [雑誌論文] Ultra-Deep Bisulfite Sequencing to Detect Specific DNA Methylation Patterns of Minor Cell Types in Heterogeneous Cell Populations: An Example of the Pituitary Tissue. (2016)
  • 著者名/発表者名: Arai Y, Fukukawa H, Atozi T, Matsumoto S, Hanazono Y, Nagashima H, Ohgane J
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 11 ページ: e0146498
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0146498.
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An epigenetic regulatory element of the Nodal gene in the mouse and human genomes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Arai D, Hayakawa K, Ohgane J, Hirosawa M, Nakao Y, Tanaka S, Shiota K
  • 雑誌名: Mech Dev 巻: 136 ページ: 143-154
  • DOI: 10.1016/j.mod.2014.12.003.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Putative Epimutagens in Maternal Peripheral and Cord Blood Samples Identified Using Human Induced Pluripotent Stem Cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Arai Y, Hayakawa K, Arai D, Ito R, Iwasaki Y, Saito K, Akutsu K, Takatori S, Ishii R, Hayashi R, Izumi S, Sugino N, Kondo F, Horie M, Nakazawa H, Makino T, Hirosawa M, Shiota K, Ohgane J
  • 雑誌名: Biomed Res Int 巻: 2015 ページ: 876047
  • DOI: 10.1155/2015/876047.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 体細胞連続核移植で作出されたクローンブタでのエピジェネティック解析：Human BeadChipを用いたゲノムワイドDNAメチル化解析の試み (2015)
  • 著者名/発表者名: 新井良和、阿閉貴紀、福川斐昭、齋藤経、竹内健太、松成ひとみ、長嶋比呂志、大鐘潤
  • 学会等名: 第108回日本繁殖生物学会
  • 発表場所: 宮崎大学
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-20
• [学会発表] 次世代シークエンサーによるブタ精巣でのウルトラディープDNAメチル化解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 齋藤経、新井良和、阿閉貴紀、竹内健太、長嶋比呂志、大鐘潤
  • 学会等名: 第108回日本繁殖生物学会
  • 発表場所: 宮崎大学
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-20