哺乳類細胞のリボソームにおいて、細胞環境の違いによってその構成成分の一部が変わる「構造不均一性」が研究代表者らの構造化学的研究により推察された。そこで独自に改良したプロテオミクスによる齧歯類リボソームおよびその関連因子の網羅的解析に取り組んだ。その結果組織特異的に含まれるリボソーム構成因子として新たなタンパク質の同定に成功し、これまでの我々の知見に加える形で、哺乳類リボソームにおける不均一性の実像にさらに迫ることに成功した。このようにして同定された不均一性因子の機能解析として、ウサギ網状赤血球溶解液を使用したin vitroにおける翻訳解析を行った。まず新規不均一性因子を組換えタンパク質として発現・精製した。組換えタンパク質が変性不溶化することを避けるため、可溶性タンパク質として発現しやすくなるタンパク質との融合タンパク質として大腸菌内で大量に発現させた。細胞内(および精製途中)での組換えタンパク質の部分分解が初期の段階で観察されたが、細胞培養条件(温度、時間等)およびアフィニティークロマトグラフィーでの精製条件(組換えタンパク質の溶出条件等)の詳細な検討によって、分解産物の混入が最小限に抑えられた組換えタンパク質が調製された。この組換えタンパク質を上述のin vitro翻訳系に加えたところ、コントロールに比べて翻訳産物量の増加が示された。こうした実験結果からリボソームの構造不均一性に担う新規因子の翻訳制御への関わりが示唆された。
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