研究課題/領域番号 |
25460403
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
人類遺伝学
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研究機関 | 東北大学 |
研究代表者 |
田宮 元 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (10317745)
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研究分担者 |
植木 優夫 久留米大学, バイオ統計センター, 講師 (10515860)
中村 智洋 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 (30537923)
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研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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キーワード | 遺伝統計学 / 人類遺伝学 / コホート研究 / 高次元変数選択法 / 遺伝子×環境相互作用 |
研究成果の概要 |
疾患発症に効果を持つ遺伝子と環境因子を、ゲノムコホート研究に典型的なp>>n条件の小標本高次元データから統計学的保証を持って、柔軟かつ高速に抽出するために、高次元変数選択の枠組みを利用した遺伝統計手法の開発を行った。具体的には、周辺回帰とそれに引き続く罰則回帰による変数選択を組み合わせた高次元変数選択の枠組み(SIS; Sure Independence Screening)を実データ、とくに遺伝子×環境相互作用データへの適用が可能となるよう拡張するための解析を行い、ソフトウェアプログラムに反映させた。
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自由記述の分野 |
人類遺伝学、遺伝統計学、ゲノム科学
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