| 研究課題/領域番号 |
25460659
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 研究機関 | 東京女子医科大学 |
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研究代表者 |
倉持 英和 東京女子医科大学, 医学部, 講師 (30287362)
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| 研究分担者 |
林 和彦 東京女子医科大学, 医学部, 教授 (10208613)
中島 豪 東京女子医科大学, 医学部, 助教 (80338996)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | CPT-11 / 遺伝子多型 |
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| 研究概要 |
CPT-11の副作用を予測しうるバイオマーカー探索として14名のCPT-11を使用した胃癌、大腸癌患者の血清よりDNAを抽出し、DMETマイクロアレイを用いて遺伝子多型のスクリーニングを行った。
DMET TM Plus はAffymetrix 社から発売されている薬物代謝・トランスポーター遺伝子解析用マイクロアレイであり、網羅的に225 遺伝子上の1,936 個の薬物代謝マーカーの解析が可能である。。特長として、一般的なSNP のみならず、挿入、欠損、トリアレル、コピー数など様々な遺伝子変異をカバーしており、従来のSNP アレイで測定不可能であった遺伝子マーカーも検討対象に加えることができ、これら多数のマーカーを一度に網羅的に解析することができるため、未知のバイオマーカーを探索するのに適している。
現在測定作業をほぼ終えつつあり、今後はそのデータの正確性の検証と統計学的な確認作業に入っていく予定である。今後、臨床データ、特に副作用のデータと遺伝子多型との関連性を検証して、有害事象を予測しうるマーカーの絞り込みを行っていく予定である。候補となるマーカーが抽出された時点で、来年度以降にその検証を行っていきたいと考えており、CPT-11を使用した今回のデータ抽出群とは別の患者群においての再現性をReal-time PCRを用いて確認していきたいと考えている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
実験補助員の確保に難航したため
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| 今後の研究の推進方策 |
今後、臨床データ、特に副作用のデータと遺伝子多型との関連性を検証して、有害事象を予測しうるマーカーの絞り込みを行っていく予定である。候補となるマーカーが抽出された時点で、来年度以降にその検証を行っていきたいと考えており、CPT-11を使用した今回のデータ抽出群とは別の患者群においての再現性をReal-time PCRを用いて確認していきたいと考えている。
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| 次年度の研究費の使用計画 |
実験補助員の確保に難航し、人件費を消費できなかった。学会出張費が予定に満たなかった。
実験補助員の確保を行い、実験を遂行する。
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