研究課題/領域番号 |
25460791
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研究種目 |
基盤研究(C)
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研究機関 | 東京大学 |
研究代表者 |
沖津 祥子 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 客員研究員 (10082215)
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研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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キーワード | ウイルス / 感染症 / アジア / 下痢症 |
研究概要 |
1.2009-2013年に日本の小児科外来を急性胃腸炎のために受診した小児2,381例から便検体を得、その原因ウイルスを検出した。70.4%が何らかのウイルス陽性であった。ノロウイルスが39.3%、ロタウイルスが20.1%で、その他ヒトパレコウイルス、エンテロウイルス、アデノウイルス、サポウイルス、アストロウイルス、アイチウイルスが検出された。ノロウイルスではGII.4が71.4%であった。2012年末にGII.4の新しいvariantであるSydney_2012が各国で検出され、この研究でも2012-2013年のノロウイルスの85.7%がこの株であった。研究期間中に流行株が変遷し、ノロウイルスカプシドのP2 domainのアミノ酸に変異が起きて集団免疫を免れ、新たな感染をおこすことがわかった。 2. タイ国チェンマイ地方の下痢症の仔ブタから検出したA群ロタウイルス4株について、全11遺伝子分節の解析を行い、この地方の報告株や世界での検出株との比較を行った。ゲノタイプ間、ゲノタイプ内での遺伝子再集合が観察された。一方、遺伝子分節によっては1989年の株の遺伝子が保存されていることがわかった。 3. Aichivirus C 属は2008年ブタで発見されたピコルナウイルス科の新しいウイルスでその病原性は不明である。中国では近年ブタの大規模な下痢症が流行し、Aichivirus Cのvariant 株(2B領域に90ntの欠失が存在)が、検出された。この研究ではタイの下痢症ブタから得た一株の全長配列を決定したところ、variant株であった。そこでタイの下痢および健康なブタ、日本の健康なブタから得た計16株の2B領域を調べたところ、すべてvariant株であった。これらの国ではvariant株が流行していること、variantであることと病原性とに関係がないことがわかった。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
1.ブタコブウイルス(現在はAichivirus C属)の一株については全長配列の決定をし、また、2B領域の解析を行った。行い、上記の結果を得た(論文投稿中)。このウイルスの培養に関して、現在培養は開始していないが、準備中である。 2.2011年にタイの下痢症の仔ブタから得た便64検体について、B群ロタウイルスの検出を行い、すべて陰性であった。低ウイルス量のため検出できなかった可能性があり、今後感度を上げて再度試みる。 3.タイ・チェンマイ地方の2012年の仔ブタ下痢便検体105検体を入手できたので、今後カリシウイルスのスクリーニングを行う予定である。 4.Aichivirus Cの培養には未だ誰も成功していない。そこでこのために細胞の選択、方法などヒトに感染するAichivirus Aでの方法を参考に準備中である。
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今後の研究の推進方策 |
1. 2012年の日本の急性胃腸炎小児から得た一検体でヒトコサウイルスが検出された。このウイルスの全長配列から、ウイルスの解析を行う。 2.2012年にタイ国チェンマイ地方の農場で採取された下痢症の仔ブタから得た検体に関して、下痢症ウイルスのスクリーニングを行う。カリシウイルス、E型肝炎ウイルスをまず考えているが、ヒトコサウイルスについても動物からの検出ができないか試みる。これはヒトでの検出率が低いにもかかわらず、河川や汚水処理場の処理汚水で高頻度に検出されるためである。 3. 現在までAichivirus Cの培養は誰も成功していない。そこでの可能性を探る。ピコルナウイルス科のウイルスに関して培養経験のある研究者と相談し、細胞の準備、方法を検討する。また、ヒトコサウイルスについても培養を試みる。 4.上記に記載したようにタイの下痢症の仔ブタから得た便64検体について、B群ロタウイルスの検出を試みたが、すべて陰性であった。低ウイルス量のため検出できなかった可能性があり、今年度は感度を上げて再度試みる。 5.これまでの研究成果を論文および学術集会で発表する。
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次年度の研究費の使用計画 |
2013年度の研究では主としてすでに検出したウイルス株を用いてその配列の決定、特徴を調べた。そこで今年度の支出は新たなプライマー作製やそれを用いたPCR反応の結果として作製できた増幅産物の配列決定を行うことが主であった。また、国内での学会発表、論文の英文修正などに研究費を使用した。 1.次年度は今まで成功していないウイルスの培養を計画しており、そのための培養液や消耗品のためのその経費が必要である。ウイルスの培養のための細胞としてはエンテロウイルスの培養に多く使われ、とくにヒトのアイチウイルスでの培養が成功しているVero細胞の培養から試みる予定である。このための取り組みとしては細胞の入手準備は進んでおり、培養液、消耗品の準備をしている。 2.また、前年度の研究結果の国際学会での発表、論文発表を予定しており、そのための経費が必要である。
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