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2014 年度 実施状況報告書

年齢依存的転写因子を基軸とした年齢推定マーカーの検索とその法医学的応用

研究課題

研究課題/領域番号 25460864
研究機関福井大学

研究代表者

植木 美鈴  福井大学, 医学部, 助手 (00165656)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
キーワード個人識別 / 年齢推定 / Mpv17-like protein / DNase family / 非同義置換型 SNP / 遺伝子型―活性相関 / 遺伝子型分布 / リスクファクター
研究実績の概要

1.従前の研究で同定したヒト年齢依存性Mpv17-like protein (M-LPH)について、その生理的役割を解明するため、M-LPH遺伝子内の非同義置換型SNPに着目した。機能への影響が予測された非同義置換型SNP(9座位)について集団遺伝学的解析を行った。各SNPの遺伝子型を判定するため、新規なPCR-RFLP法を確立した。本判定法によって、3大人種を含む異なる14集団における遺伝子型分布を調べたところ、すべてmono-allelicな分布を示した。従って、各SNPのminor allele frequencyは0.0003以下と算定され、これら非同義置換型SNPについてM-LPH遺伝子の遺伝的多様性は極めて低いことが明らかとなった。
2.M-LPHの生理的役割解明の一助として、免疫沈降法などによって相互作用するタンパク質を検索した。その結果、M-LPHはhistone H2AX、ribosomal protein RPS3及びRPS14などと相互作用することが明らかとなった。現在、それら知見に基づき、生理的機能を明らかにするよう細胞生物学的解析を進めている。
3.年齢依存的に活性変動するDNase Iについて、その病態生理学的役割を解明する一環として、全非同義置換型 SNP(64座位)の遺伝子型―活性相関を解析した。その結果、11座位のloss-of-function 型SNPを同定した。これらSNPは自己免疫疾患のリスクファクターとなるものである。
4.DNase Iと同様にDNase familyに属するDNase I-like 2についても、全非同義置換型 SNP(35座位)の遺伝子型―活性相関を解析した。その結果、9座位のloss-of-function 型SNPを同定した。これらSNPは尋常性乾癬など不全角化病変のリスクファクターとなるものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

以下の理由から、「おおむね順調に進展している」と判断した
①本研究の遂行によって、関連研究を含めその成果を6報の査読ある欧文学術雑誌に公表した。
②年齢依存的生体分子M-LPHについて、その生理的役割を解明する一助となる、非同義置換型SNPの遺伝的基盤が確立できた。
③M-LPHの生理的役割を解明するための細胞生物学的解析が進展した
④年齢依存的変動を示すDNase familyについて、その病態遺伝学的関与を解明する一助となる、loss-of-functionを産生するfunctional SNP群を同定した。

今後の研究の推進方策

①本年度に得られた知見を基に、M-LHPの生理的機能を解明するための細胞生物学的解析を進めることとしている。
②M-LPH遺伝子について、遺伝子型―活性相関解析を行うこととしている。
③年齢推定マーカーとなる新規な年齢依存性生体分子や遺伝子を同定するためには異なる年齢層の試料が不可欠であり、前年度に続き連携研究者に採取を依頼し、収集を進める。
④異なる年齢由来の試料を使用して、microarray法などによって、年齢依存的に顕著な発現変動を示す遺伝子群を網羅的に検索することとしている。

次年度使用額が生じた理由

研究用試薬など消耗品を購入する際「キャンペーン」時に購入するなど工夫したため、当初計上していた物品費が予定額より若干少ない金額で研究を遂行できた。このため次年度使用額が生じた。

次年度使用額の使用計画

残額は本年度要求する研究費の物品費に合わせ、平成27年度計画の研究遂行に使用する。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Global analysis of genetic variations in a 56-bp variable number of tandem repeat polymorphisms within the human deoxyribonuclease I gene2015

    • 著者名/発表者名
      J.Fujihara, T.Yasuda, R.Iida, M.Ueki, R.Sano, Y.Kominato, K.Kimura, H.Takeshita
    • 雑誌名

      Legal Medicine

      巻: 17 ページ: 283-286

    • DOI

      10.1016/j.legalmed.2015.01.005

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of functional SNPs potentially served as a genetic risk factor for the pathogenesis of parakeratosis in the gene encoding human deoxyribonuclease I-like 2 (DNase 1L2) implicated in terminal differentiation of keratinocytes2015

    • 著者名/発表者名
      Misuzu Ueki
    • 雑誌名

      Gene

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.gene.2015.01.006

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Distribution of the rs3136794 polymorphism of the DNA polymerase beta gene, involved in the base excision repair pathway, in world-wide population2015

    • 著者名/発表者名
      Kaori Kimura
    • 雑誌名

      Indian Journal of Clinical Biochemistry

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evaluation of all non-synonymous single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the genes encoding human deoxyribonuclease I and I-like 3 as a functional SNP potentially implicated in autoimmunity2014

    • 著者名/発表者名
      Misuzu Ueki
    • 雑誌名

      FEBS Journal

      巻: 281 ページ: 376-390

    • DOI

      10.1111/febs.12608

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Evaluation of all non-synonymous single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the gene encoding human deoxyribonuclease I-like 1, possibly implicated in the blocking of endocytosis-mediated foreign gene transfer2014

    • 著者名/発表者名
      Misuzu Ueki
    • 雑誌名

      DNA Cell Biology

      巻: 33 ページ: 79-87

    • DOI

      10.1089/dna.2013.2248

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of the functional alleles of the non-synonymous single-nucleotide polymorphisms potentially implicated in autoimmunity in the human deoxyribonuclease I gene2014

    • 著者名/発表者名
      Misuzu Ueki
    • 雑誌名

      DNA Cell Biology

      巻: 33 ページ: 492-502

    • DOI

      10.1089/dna.2014.2368

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] DNase I-like 2遺伝子の非同義置換型SNPは尋常性乾癬など不全角化病変のリスクファクターである2014

    • 著者名/発表者名
      藤原 純子
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 22 ページ: 187-191

  • [学会発表] ヒ素のメチル化能に関するXRCC1多型とその頻度の世界比較2014

    • 著者名/発表者名
      藤原 純子
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第23回学術集会
    • 発表場所
      ウインクあいち(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2014-11-21
  • [学会発表] 自己免疫疾患関連DNase I遺伝子におけるfunctional SNPs;遺伝的リスクファクターの検索2014

    • 著者名/発表者名
      藤原 純子
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第23回学術集会
    • 発表場所
      ウインクあいち(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2014-11-21
  • [学会発表] A case of death in a bathtub from hypothermia even in medsummer2014

    • 著者名/発表者名
      Kaori Kimura
    • 学会等名
      9th International Symposium on Advances in Legal Medicine
    • 発表場所
      Fukuoka International Congress Center (福岡県福岡市)
    • 年月日
      2014-06-20
  • [学会発表] Genetic and expression analysis of all the nonsynonymous and autoimmunity-related SNPs in the human deoxyribonuclease II gene2014

    • 著者名/発表者名
      Kaori Kimura
    • 学会等名
      9th International Symposium on Advances in Legal Medicine
    • 発表場所
      Fukuoka International Congress Center (福岡県福岡市)
    • 年月日
      2014-06-18

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公開日: 2016-05-27  

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