| 研究課題/領域番号 |
25461530
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
感染症内科学
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| 研究機関 | 富山県衛生研究所 |
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研究代表者 |
滝澤 剛則 富山県衛生研究所, その他部局等, 部長 (40192158)
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| 連携研究者 |
名古屋 真弓 富山県衛生研究所, ウイルス部, 主任研究員 (80393081)
稲崎 倫子 富山県衛生研究所, ウイルス部, 研究員 (40633665)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | ノロウイルス / 環境水 / 発生動向調査 / サーベイランス / メタゲノム |
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| 研究成果の概要 |
次世代シークエンサー（NGS）を用いて、胃腸炎事例のメタゲノム解析を行った。定法ではノロウイルス（NoV）陰性だった検体からもNoVが検出され、因果関係の推定可能事例が存在した。PCR産物のディープシークエンス解析では、単一遺伝子型暴露と考えられた事例でも、複数の遺伝子型の感染が推定された。カキ喫食事例では、複数のNoV遺伝子型やNoV以外のウイルスが検出され、カキに含まれる複数種のウイルス暴露が推定された。
メタゲノム解析により、遺伝子型と病因との関連を推定できることが判明したが、十分なNoVのリード数を得ることが困難であったため、塩基配列の多様性と病因との関連は議論できなかった。
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| 自由記述の分野 |
ウイルス学
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