研究課題
基盤研究(C)
West症候群は群発するスパズムとヒプスアリスミアを特徴とし、しばしば発達の停滞、退行を伴うてんかん性脳症である。このうち発症前に神経学的異常が無く、画像検査、生化学で異常を認めない潜因性West症候群の患者は全体の１～３割程度とされており、発症の原因および機序の同定に至っていない。名古屋大学医学部附属病院小児科は以前から潜因性West症候群の臨床研究を行っており、愛知県のみならず近隣からも患者が来院するため、症例の蓄積が豊富である。今回、潜因性West症候群の家系内発症例の遺伝的要因を検索するため、２家系において次世代シークエンス解析を施行した。1家系目は兄弟発症の家系で、父・母・同胞の３名を含む５名の血液検体を用いて、次世代シークエンス解析を行った。10万以上のSNV（single nucleotide polymorphism）のうち、チャネル関連遺伝子、てんかん関連遺伝子を含む325遺伝子パネルを作成し、エクソン上の蛋白変化を伴う変異について、発症者に共通する突然変異、ホモ接合変異、compound hetero変異、X-linked変異を検索した。このうちでデータベース上の頻度の低いX-linked のSNVを認めた。現在はさらにパネル上の候補遺伝子を広げ、再度検索を行っている。2家系目は母子発症の家系で、発症児の父・同胞の２名を含む４名の血液検体を用いて、同じく次世代シークエンス解析を行った。先述した遺伝子パネルを用い、発症者２名に共通する７つの遺伝子に病原性を疑うSNVを認め、現在さらなる解析を行っている。
3: やや遅れている
対象とした2家系について、次世代シークエンサーを用いた網羅的解析を施行した。現在、バイオインフォマティクス解析にて候補遺伝子を絞り込む作業を継続している。得られたデータから候補遺伝子を絞り込む作業が難渋しているため、サンガー法を用いた変異確認には至っていない。
バイオインフォマティクス解析による候補遺伝子の絞り込みと、サンガー法を用いた変異確認を施行する。遺伝子変異を同定した後、その変異タンパクの機能解析を行い、病気の発症との関連を検討する。また同様の臨床型を有する弧発例についても候補遺伝子における変異解析を施行する。
本研究計画は3年間で計画している。初年度は次世代シークエンサーを用いた2家系の網羅的遺伝子解析を行ったが、候補遺伝子の絞り込みに時間を費やしたため、変異確定に必要なサンガーシークエンス、さらに弧発例の解析には着手できていない状況である。これらの解析を次年度以降に行う予定である。候補遺伝子の絞り込みを行った後、サンガーシークエンス解析にて変異の確定を行う予定である。さらに、弧発例における同遺伝子の変異解析、機能解析を行っていく予定である。これらの解析にはさらに研究費を必要とする。
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AJNR Am J Neuroradiol
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