ゲノムワイド父性ダイソミ―の分子病態に関する研究

2014 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 25461648
• 研究機関: 佐賀大学
• 研究代表者: 大塚 泰史 佐賀大学, 医学部, 助教 (50448479)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 全ゲノム父性ダイソミー / Beckwith-Wiedemann症候群 / 次世代シークエンサー / インプリント疾患

研究実績の概要

①Beckwith-Wiedemann症候群（BWS）の診断基準を満たした、ゲノムワイド父性ダイソミー（GWPUPD: Genome-Wide Paternal Uniparental Disomy）4症例について、SOLiD5500を用いた全ゲノム解析を行った。
②常染色体劣性遺伝子異常が疑われる遺伝子については、症例BWS045において222遺伝子、症例Bwsh21-002において218遺伝子、症例Bwsh21-051において331遺伝子、症例Bwsh21-078において331遺伝子を抽出した。
③さらにFrameshift mutation のdeletionもしくはinsertionを示す遺伝子が、症例BWS045において9遺伝子、症例Bwsh21-002において8遺伝子、症例Bwsh21-051において3遺伝子、症例Bwsh21-078において8遺伝子認めた。
④症例BWS045において臨床診断されていたシスチン尿症については、SOLiD5500の結果でもSLC7A9（Chr. 19 q13.1）のFrameshift mutationが検出できた。また本症例については、GWPUPDに合併した常染色体劣性遺伝子疾患を初めて確認した症例としてClinical Geneticsに報告した。

現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

Frameshift mutationとして認められた遺伝子が、OMIMで確認できる遺伝子疾患と関連が乏しいため、遺伝子異常と各GWPUPD症例との関連性を見出し難い状況である。また点変異についても検討をしており、モザイク率90％以上の2例は検出が可能であるが、低い2例については、検出方法を模索しているが難渋をしている。

今後の研究の推進方策

Frameshift変異、点変異についてはさらに情報をまとめる。
また4症例の臨床症状と遺伝子異常との関連を検討し、さらに劣性遺伝子異常が含有されている可能性について追及をする。最終的にはSanger法で確認をする予定である。

次年度使用額が生じた理由

解析キットなどを購入し、僅か残額が生じた。

次年度使用額の使用計画

次年度の消耗品として使用する予定。

研究成果

• [雑誌論文] Autosomal recessive cystinuria caused by genome-wide paternal uniparental isodisomy in a patient with Beckwith-Wiedemann syndrome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuka Y, Higashimoto K, Sasaki K, Jozaki K, Yoshinaga H, Okamoto N, Takama Y, Kubota A, Nakayama M, Yatsuki H, Nishioka K, Joh K, Mukai T, Yoshiura KI, Soejima H.
  • 雑誌名: Clin Genet. 巻: 8 ページ: 1
  • DOI: 10.1111/cge.12496.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive and quantitative multilocus methylation analysis reveals the susceptibility of specific imprinted differentially methylated regions to aberrant methylation in Beckwith-Wiedemann syndrome with epimutations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Maeda T, Higashimoto K, Jozaki K, Yatsuki H, Nakabayashi K, Makita Y, Tonoki H, Okamoto N, Takada F, Ohashi H, Migita M, Kosaki R, Matsubara K, Ogata T, Matsuo M, Hamasaki Y, Ohtsuka Y, Nishioka K, Joh K, Mukai T, Hata K, Soejima H.
  • 雑誌名: Genet Med. 巻: 16 ページ: 903
  • DOI: 10.1038/gim.2014.46.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alport syndrome caused by a COL4A5 deletion and exonization of an adjacent AluY. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nozu K, Iijima K, Ohtsuka Y, Fu XJ, Kaito H, Nakanishi K, Vorechovsky I
  • 雑誌名: Mol Genet Genomic Med 巻: 2 ページ: 451
  • DOI: 10.1002/mgg3.89.
  • 査読あり
• [学会発表] 小児腎臓医からみた成人腎Fabry病スクリーニング． (2014)
  • 著者名/発表者名: 大塚泰史
  • 学会等名: 日本小児腎臓病学会
  • 発表場所: 秋田
  • 年月日: 2014-06-05 – 2014-06-07