研究課題
ゲノム上に存在するトランスポゾンであるLINE(Long interspersed nuclear element) (長鎖散在性核内反復配列)は、全ゲノムに存在しており、この反復配列におけるメチル化の状態は、ゲノム全体のメチル化を反映する。我々は、食道癌、胃癌、大腸癌においてLINE-1のメチル化状態を検討した。癌組織でLINE-1のメチル化は減少していたが、DNAミスマッチ修復遺伝子の発現が低いMSIの腫瘍では、LINEメチル化の低下の頻度は低く、反対のMLH1などのプロモーターの高メチル化が観察された。この相反するメチル化状態の違いに炎症メディエーターが関与している可能性がある。現在それぞれのメチル化の異常がどのような炎症メディエーターの多可に左右されているのかをretrospectiveに解析を進めている。さらに、その炎症メディエーターがメチル化を生じさせるメカニズムを演繹的に証明する。具体的には以下の順序で解析を進める①大腸癌ゲノムのメチル化の検討:大腸癌手術検体のbisufite sequenceによりLINE1のゲノム上に散在するLINE1の中の3ヵ所のメチル化サイトにおけるメチル化の頻度の平均値を定量し、ゲノム全体のメチル化状態を評価すしている。②特定のDNA修復遺伝子のメチル化の検討:DNA修復遺伝子であるMTH1ホモログの発現を胃癌組織において検討したとところ、特定の癌で発現が低下しているため、メチル化状態との関係を検討中である。③炎症メディエーターの組織、血液内での測定:癌におけるプロスタグランジンやサイトカイン、ケモカイン、ケモカイン受容体などの多可を組織、血液などを使って定量評価している。
2: おおむね順調に進展している
LINE-1については現在論文作成中。また大腸癌のミスマッチ修復との関係についても検討が終了し、論文作成予定である。
予定通り遂行予定。ただし炎症とDNA修復との関係により特化していく可能性がある。
当初予定していた胃癌のLINE1のメチル化の解析が、予定より時間を要し、全予定症例が当該年度では終了しなかった為。当初予定していた胃癌のLINE1のメチル化の解析を次年度行う為に必要な試薬を次年度繰越額242,672円で購入する
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Ann Surg Oncol
巻: 7 ページ: 2014
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