地球上の細胞には原核細胞と真核細胞がある。原核細胞は環境で生き残ることに特化されている。真核細胞は核、ミトコンドリア、ゴルジ体等のオルガネラ(細胞小器官)を持つ。オルガネラは原核細胞の共生を起源とし、多細胞生物において様々な高次機能を実現している。本研究はオルガネラ計算の枠組みを提案し、合成生物学と計算機シミュレーションによってその計算能力を明らかにする。 現状ではミトコンドリアの遺伝子組み換えが技術的に困難であることから、生体分子DNAの熱力学的特性を利用して機能性ナノマシンを構築した。また、計算機のLinuxオペレーティングシステム上で直接動作し、進化する人工生命プログラムを開発した。
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