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2013 年度 実施状況報告書

プライバシー保護バイオインフォマティクス基盤技術の開発と応用

研究課題

研究課題/領域番号 25540131
研究種目

挑戦的萌芽研究

研究機関東京大学

研究代表者

浜田 道昭  東京大学, 新領域創成科学研究科, 特任准教授 (00596538)

研究分担者 清水 佳奈  独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノム情報研究センター, 研究員 (60367050)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワードプライバシー保護 / データベース検索 / 配列検索
研究概要

準同型暗号を用いた化合物データベースに対する秘密検索アルゴリズムの開発、および、実装を行った。また、マルチパーティー計算等の既存の手法との評価を行い、機密性を担保したまま高速に検索が実現できることを確かめた。論文は現在投稿中である。ここで開発した手法は、特徴ベクトルベースの秘匿検索技術に応用が可能であるため、応用先についての検討も行った。
「バイオインフォマティクスにおけるプライバシー保護データマイニング」という文章を執筆した。この中では、バイオインフォマティクスのPPDM研究に対して寄与しそうな論文のサーベイを包括的に行った。この中で、Privacy preserving string comparisons based on Levenshtein distanceの論文に特に注目して、この論文で用いられている方法を発展させて、プライバシー保護ホモロジー検索技術の理論を現在構築中である。
アラインメントツールLAST(http://last.cbrc.jp/)に、秘匿計算機能を持たせるための様々な検討を行った。化合物データベースの秘匿計算を用いた探索と同様に、可能な限り準同型暗号ベースでの秘匿計算が行えることを目指してアルゴリズムの開発を行っている。また、LASTの実装を入念に調査をし、LASTの中に秘匿計算を用いた方法を実装するための問題になりそうな部分に関する洗い出しを行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

特徴ベクトルを用いた秘匿検索技術の開発に関しては、その基本となる化合物データベースの秘匿検索技術を確立している。
プライバシー保護配列解析技術の開発に関しても、利用するアルゴリズムの設計を現在行っている段階である。

今後の研究の推進方策

研究代表者は2014年4月1日より、早稲田大学に本務先が変更になったが、週に2度程度産総研に来所し、共同研究者との連携を図る予定である。

次年度の研究費の使用計画

本年度は、研究者自身による調査やプロトタイプの作成を行ったため費用がかからなかった。次年度以降に、開発が本格化する時に備えて費用を蓄えておいたため。
開発案件で仕様が固まる部分に関しては、学生アルバイトや外注を用いて効率的に行う。その際の費用として計上する予定。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2013

すべて 学会発表 (2件) (うち招待講演 1件)

  • [学会発表] 次世代バイオインフォマティクス技術の研究開発2013

    • 著者名/発表者名
      浜田道昭
    • 学会等名
      医薬会セミナー
    • 発表場所
      国立国際医療研究センター、東京都
    • 年月日
      20130925-20130925
    • 招待講演
  • [学会発表] Privacy-preserving search for a chemical compound database2013

    • 著者名/発表者名
      Kana Shimizu, Hiromi Arai, Koji Nuida, Michiaki Hamada, Koji Tsuda, Jun Sakuma, Takatsugu Hirokawa, Goichiro Hanaoka, Kiyoshi Asai,
    • 学会等名
      ISMB/ECCB 2013
    • 発表場所
      ベルリン、ドイツ
    • 年月日
      20130721-20130723

URL: 

公開日: 2015-05-28  

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