| 研究課題/領域番号 |
25550035
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 研究機関 | 大阪府立大学 |
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研究代表者 |
川西 優喜 大阪府立大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70332963)
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| 研究分担者 |
足立 淳 独立行政法人医薬基盤研究所, 創薬基盤研究部, プロジェクト研究員 (20437255)
白石 一乗 大阪府立大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (40347513)
八木 孝司 大阪府立大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (80182301)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | 自然放射線 / マイクロアレイ |
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| 研究概要 |
自然放射線を遮蔽するとマウス細胞の増殖が低下する。しかしその分子メカニズムは不明である。そこで、高性能な自然放射線遮蔽装置と最新のオミクステクノロジーを用いて、自然放射線遮蔽下で発現の変動する遺伝子・ パスウェイを網羅的に探索する。
本年度はDNAマイクロアレイ解析を用いた、細胞増殖やDNA修復と関連のある候補遺伝子を選別を目指した。遮蔽装置・培養機器の再起動をおこない、最適な培養条件を探った。特に今年度は、交付申請額に適合したマイクロアレイ外注条件を探る必要が生じた。そこで、アレイ分析条件、すなわち比較条件を絞り込むため、遮蔽・培養環境の条件検討をおこなった。
今後は最適化された条件でRNAを抽出し、DNAマイクロアレイ解析をおこなう。今回の検討でわかった新しい実験条件でマウス細胞を培養、核酸を抽出し、アレイ分析(mRNA発現の比較分析)を外注する。細胞増殖やDNA修復と関連のある候補遺伝子を選別する。その後、質量分析計を用いて、その遺伝子産物の蛋白質複合体解析を行う。得られたオミクス情報を、解析ソフトウェアを用いてデータベース情報と照合し、既知の生体分子のネットワーク/パスウェイと結びつける。
本研究によって自然放射線遮蔽下の増殖抑制現象を細胞応答システムとして分子レベルで全体像を理解し、その後の個々の遺伝子・たんぱく質の機能研究につなげる。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
交付申請額に適合したマイクロアレイ外注条件を探る必要が生じた。比較数を減らすための実験条件を検討したため、当初の予定より遅れが生じた。
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| 今後の研究の推進方策 |
最適化された条件でRNAを抽出し、DNAマイクロアレイ解析をおこなう。細胞増殖やDNA修復と関連のある候補遺伝子を選 別する。
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| 次年度の研究費の使用計画 |
交付申請額に適合したマイクロアレイ外注条件を探る必要が生じた。比較数を減らすための実験条件を検討したため、当初の予定より遅れが生じ、予定した外注がおこなえなかった。
新しい条件でのアレイ分析(比較)を外注する。
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