2014 年度研究成果報告書

ハプロイドゲノムの解読・多型解析による高精度ゲノムシーケンス・連鎖地図の作製

研究課題

研究課題/領域番号	25640099
研究種目	挑戦的萌芽研究
配分区分	基金
研究分野	ゲノム生物学
研究機関	東京大学
研究代表者	浅川修一東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 教授 (30231872)
研究期間 (年度)	2013-04-01 – 2015-03-31
キーワード	ゲノムシーケンシング / トラフグ / ニジマス / ブリ / 雌性発生 / ダブルハプロイド / ハプロイド / ホモ接合
研究成果の概要	本研究では魚類における雌性発生の技術を用いてダブルハプロイド／ハプロイドの個体を作製し、それをゲノムシーケンシング、およびSNPタイピングによる連鎖地図作製への活用を検討した。ゲノムシーケンシングの結果、ダブルハプロイドの個体では通常のヘテロ２倍体個体よりコンティグやスキャホールドのN50において、はるかに長いシーケンスデータを得ることができ、二倍体生物の新規シーケンシングに関してダブルハプロイド／ハプロイド個体を用いることの有効性を明らかにできた。
自由記述の分野	ゲノム科学