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2014 年度 研究成果報告書

超高速in-cell NMR動的構造解析法によるSox2の細胞内動態解明

研究課題

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研究課題/領域番号 25650056
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生物物理学
研究機関公益財団法人サントリー生命科学財団

研究代表者

菅瀬 謙治  公益財団法人サントリー生命科学財団, その他部局等, 主席研究員 (00300822)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードin-cell NMR / タンパク質 / 揺らぎ / 高速測定
研究成果の概要

細胞内における転写因子Sox2の揺らぎをNMRで高速に解析するために、NMR測定のための試料調製法、NMR測定法、データ解析法の開発を行った。試料調製法では、2% DMSOで細胞を処理することによって蛋白質をより効率よく細胞内に導入できた。NMR測定法では、水シグナルを選択的に励起させて水と交換しやすい柔らかい構造領域を同定する測定法が高速揺らぎ測定に有効であることがわかった。また間引いて2次元NMR測定を行う非線形サンプリング法を導入し、かつ間引かれたデータを計算的に復活させるSIFT法の改良を行った。その結果、従来の1/3程度の時間でNMR測定を完了できるようになった。

自由記述の分野

構造生物学

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公開日: 2016-09-02  

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