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2014 年度 実績報告書

シアノバクテリアのマクロなコロニーパターンの構築原理

研究課題

研究課題/領域番号 25650111
研究機関早稲田大学

研究代表者

岩崎 秀雄  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (00324393)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードシアノバクテリア / パターン形成 / 形態形成 / コロニーパターン
研究実績の概要

前年度に引き続き,GeitlerinemaとPseudanabaenaの二種類のシアノバクテリアのコロニーパターンに関する解析を行った。

1.Geitlerinemaのコロニーパターンダイナミクスの解析: Geitlerinema sp.に特有な,安定な軌道を伴う渦状コロニーパターン形成に関して,前年度の成果をもとに主としてシミュレーションによる解析と,ゲノムDNA解析を行った。前者については,セルオートマトンを用い,Vicsekモデルを改変したシミュレーションにより,以前から提案してた軌道安定性を伴うコロニーパターン形成モデルを用いて現実のパターンの一部が再現できることを示した。また,共同研究により,次世代シーケンサーを用いたde novoシーケンシングを行った。その際,前年度までに分離していた,コロニーパターン形成変異株のゲノムDNAも解読し,変異箇所の同定を試みた。その結果,いくつかの遺伝子の塩基配列に変異が見つかった。

2.Pseudanabaenaのコロニーパターンダイナミクスの解析: Pseudanabeanaは円盤状および彗星状の特徴的なコロニーを呈する。定量的な顕微鏡観察から得られたパラメータをもとに,数理モデルを作成し,基本的な三つのコロニーパターン(束状,円盤状,彗星状)の形成と遷移のダイナミクスの一部を表現することに成功した(高松早大教授との共同研究)。また,世代シーケンサーを用いたde novoシーケンシングを行った。まだ,いくつかのギャップ配列があり,完全長決定には至っていない。前年度までに分離していた,Pseudanabaneaの個体長変異株のゲノムDNAも解読し,変異箇所の同定を試みた。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2015 2014

すべて 学会発表 (4件)

  • [学会発表] 多細胞性シアノバクテリアを用いた時計細胞における細胞間連絡機構の解析に向けて2015

    • 著者名/発表者名
      板木大知、櫛笥博子、久下沼秀之、岩崎秀雄
    • 学会等名
      時間生物フォーラム東京2015
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-03-28 – 2015-03-28
  • [学会発表] 運動性糸状シアノバクテリアPseudanabaena sp.のコロニーパターン解析2014

    • 著者名/発表者名
      山本 宏輝, 東海林 祐, 小林 大晃, 深澤 有貴, 岩崎 秀雄
    • 学会等名
      微細藻類研究会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2014-12-22 – 2014-12-22
  • [学会発表] 運動性シアノバクテリアPseudanabaena sp. ILC545の「彗星状コロニー」の形成ダイナミクス2014

    • 著者名/発表者名
      東海林祐、山本宏輝、深澤有貴、岩崎秀雄
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-25
  • [学会発表] Analysis on colony formation in a filamentous cyanobacterium with an extended self-driven particle model with a cellular automaton.2014

    • 著者名/発表者名
      石井理人、深澤有貴、瀧口雅也、柳佳音、岩崎秀雄
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-25

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公開日: 2016-06-01  

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