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2013 年度 実施状況報告書

嫌気性真核微生物における新規ステロール代替物質の探索

研究課題

研究課題/領域番号 25650132
研究種目

挑戦的萌芽研究

研究機関独立行政法人海洋研究開発機構

研究代表者

瀧下 清貴  独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋・極限環境生物圏領域, 主任研究員 (90392951)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワード原生生物 / 嫌気 / 細胞膜 / ステロール
研究概要

ミトコンドリアが退化し嫌気環境に適応している原生生物の1グループであるフォルニカータ生物群の5つの培養株(Carpediemonas membranifera,Ergobibamus cyprinoides,Kipferlia bialata,Dysnectes brevisおよび未記載1種)から脂質画分を抽出し,それをGC/MS解析に供した。その結果,すべての株において,真核生物で一般的に検出されるステロール,繊毛虫や一部の嫌気性原生生物が有しているテトラヒマノール,さらにはそれに相当するような化合物が一切検出されなかった。またC. membranifera,E. cyprinoides,K. bialata,D. brevisのRNA-Seqデータの中にステロールやテトラヒマノールの合成に関与する遺伝子,あるいはそれらと有意に相同性のある遺伝子は確認されなかった。このことから,該当の生物は真核生物特有の柔軟性を維持した細胞膜を有しているにも関わらず,その中にはステロール/テトラヒマノール代替物質は存在しない可能性が示唆された。その一方で,嫌気性ケルコゾア生物(未記載)のRNA-Seqデータ中にテトラヒマノール合成酵素をコードする遺伝子,嫌気性ブレビアータ生物Pygsuia biformaのRNA-Seqデータ中にスポルレン合成酵素をコードする遺伝子が存在することを新たに確認した。このことから,真核生物におけるステロール代替物質の多様性は予想以上に高い可能性が示された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

一部の嫌気性原生生物の細胞膜中にはステロール/テトラヒマノール代替物質が存在しないことを確認できたため。

今後の研究の推進方策

ステロール代替物質が存在しない嫌気性原生生物の細胞膜中のリン脂質には,ステロールおよびその代替物質を有している真核生物には認められない特徴が存在する可能性がある。今後は,該当原生生物のリン脂質に注目し,その組成解析を行なう。

次年度の研究費の使用計画

国際学会2名分の旅費を計上していたが,実際には1名の参加となったため。
遺伝子解析外注経費に当該助成金を追加し,その解析スケールを大きくする。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Lateral transfer of eukaryotic ribosomal RNA genes: an emerging concern for molecular ecology of microbial eukaryotes2014

    • 著者名/発表者名
      Akinori Yabuki, Takashi Toyofuku, Kiyotaka Takishita
    • 雑誌名

      ISME Journal

      巻: 8 ページ: 1544-1547

    • DOI

      doi:10.1038/ismej.2013.252

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A novel alveolate in bivalves with chemosynthetic bacteria inhabiting deep-sea methane seeps2013

    • 著者名/発表者名
      Fumiya Noguchi
    • 雑誌名

      Journal of Eukaryotic Microbiology

      巻: 60 ページ: 158-165

    • DOI

      doi: 10.1111/jeu.12017

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fine structure of Telonema subtilis Griessmann, 1913: a flagellate with a unique cytoskeletal structure among eukaryotes2013

    • 著者名/発表者名
      Akinori Yabuki
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 164 ページ: 556-569

    • DOI

      doi: 10.1016/j.protis.2013.04.004

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 酸素の無い環境に生息する真核生物の細胞膜および食作用にまつわるエトセトラ – 原始真核細胞モデル:嫌気性原生生物2013

    • 著者名/発表者名
      瀧下清貴
    • 雑誌名

      細胞工学

      巻: 32 ページ: 1286-1288

  • [学会発表] 珪藻寄生捕食性原生生物Hemistasia phaeocysticolaの系統分類学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      矢吹彬憲
    • 学会等名
      日本藻類学会
    • 発表場所
      東邦大学,千葉県
    • 年月日
      20140314-20140316
  • [学会発表] 不等毛植物門ディクティオカ藻綱Ciliophrys infusionumのゲノム断片より見いだされたrRNA遺伝子の水平伝搬2013

    • 著者名/発表者名
      矢吹彬憲
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 発表場所
      北海道大学,北海道
    • 年月日
      20130913-20130915
  • [学会発表] Ribosomal RNA gene laterally transferred from a perkinsid alveolate to Ciliophrys infusionum (Stramenopiles, Dictyochophyceae)2013

    • 著者名/発表者名
      Akinori Yabuki
    • 学会等名
      The ICOP XIV - International Congress of Protistology
    • 発表場所
      The Westin Bayshore, Vancouver, CANADA
    • 年月日
      20130728-20130802

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公開日: 2015-05-28  

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