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基盤塩基配列データ迅速構築法として、花粉一粒DNAの全ゲノム増幅法の基礎技術開発を行った。その材料として当初予定していたシロイヌナズナではなく、既に研究室に保存してあったマツ属花粉を用いた。具体的には、花粉に含まれるゲノムDNAを全ゲノム増幅法によって増幅し、葉緑体DNAの塩基配列解析を行うことに成功した。なおこの手法では、材料（DNA）が極微量であることから、試料とは別に混在（コンタミネーション）したDNAを除去するために、エンドヌクレアーゼとエキソヌクレアーゼを用いて花粉表面に付着したDNAの除去、さらにPCRキャリーオーバー防止試薬を使用してキャリーオーバーによる偽陽性を防止した。
一方、パーソナル次世代シーケンサーによる花粉DNAの網羅的解読手法の基礎技術開発にも取り組んだ。解析用ライブラリーの構築および解析手法として、当初はRAD-seq (restriction-site associated DNA sequence)の手法を適用することを計画していたが、技術的な問題点が明らかになったため、別途新たな手法を考案し、その新手法をほぼ完成させた。この手法開発に予定よりも時間がかかってしまったため、花粉粒を用いた連鎖解析や、そのデータを用いた既存ゲノム情報との比較解析には至っていない。
次のステップとして、ゲノムサイズが最も大きい仲間の一つと考えられている非モデル植物のユリ科植物を対象として、その連鎖解析の基盤となる、交配家系を用いたゲノム情報の取得に着手した。
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