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生態系変化を理解するためには、環境や生物の数の変化だけでなく生物の形質の変化（環境応答や進化等による）もとりいれる必要がある。生物の形質変化は生物内の分子機構に起因するため、生物内分子から生物間相互作用までの包括的解析を要する。本研究では、微生物を用いて極度に単純化した人工生態系を継代して実験室内で進化させることで、実世界におけるある一つの生態系での進化動態・個体群動態・生体内反応動態を再構成し、これらの実験結果を全て矛盾なく説明できる数理モデルを構築した。これにより生物間協力の維持や生物の適応機構など、生態系変化の理解に重要な知見を得た。
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