染色体構成の急速な変化がみられる霊長類：反復配列の関与に関する仮説の検証

2014 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 25650152
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 古賀 章彦 京都大学, 霊長類研究所, 教授 (80192574)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: 反復配列 / 増幅 / 霊長類 / セントロメア

研究実績の概要

平成２５年度に、ヨザルに特有の大規模反復配列であるOwlRepに関して種々の解析を行い、論文として発表していた (DNA Research 2014)。主な結果は、内部に複雑な構造をもつこと、アクロセントリック染色体の短碗の主要成分であること、染色体から染色体に伝播して広がったと推察されることである。
平成２６年度は、マーモセットのアルファサテライトDNAを対象とした。アルファサテライトDNAは、霊長類のセントロメア反復配列の主要DNA成分である。マーモセットのアルファサテライトDNAは、反復単位間の塩基配列の類似度が高い。霊長類全般で70-90%であるのに対して、99%以上の値を示す。これは、アルファサテライトDNAが最近急速な増幅を遂げたことを意味する。類似度が高いこと、および内部に高次構造がみられることを論文にまとめて、受理に至っている（Scientific Reports 2015予定）。また、プラスミドをベクターとするクローンを維持した場合に崩壊が起こりやすいことも、新たな発見となった。これに付随して、崩壊を避けてクローンとして維持する方法を開発し、論文として発表した (Genetice Research 2014)。

研究成果

• [雑誌論文] Higher-order repeat structure in alpha satellite DNA occurs in New World monkeys and is not confined to hominoids (2015)
  • 著者名/発表者名: Sujiwattanarat P, Thapana W, Srikulnath K, Hirai Y, Hirai H, *Koga A
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 未定 ページ: 未定
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Reduction in the structural instability of cloned eukaryotic tandem-repeat DNA by low-temperature culturing of host bacteria (2014)
  • 著者名/発表者名: Thapana W, Sujiwattanarat P, Srikulnath K, Hirai H, *Koga A
  • 雑誌名: Genetics Research 巻: 96 ページ: e13
  • DOI: http://dx.doi.org/10.1017/S0016672314000172
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Locational diversity of alpha satellite DNA and intergeneric hybridization aspects in the Nomascus and Hylobates genera of small apes (2014)
  • 著者名/発表者名: Baicharoen S, Miyabe-Nishiwaki T, Arsaithamkul V, Hirai Y, Duangsa-ard K, Siriaroonrat B, Domae H, Srikulnath K, Koga A, *Hirai H
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 ページ: e109151
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0109151
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] DNA-based transposable elements as natural mutators in vertebrate genomes (2014)
  • 著者名/発表者名: Akihiko Koga
  • 学会等名: 2014 International Conference of the Korean Society for Molecular and Cellular Biology
  • 発表場所: COEX (Seoul, Korea)
  • 年月日: 2014-10-21 – 2014-10-23
  • 招待講演
• [学会発表] Higher-order repeat structure in centromeric repetitive DNA is not confined to central regions (2014)
  • 著者名/発表者名: Penporn Sujiwattanarat, Watcharaporn Thapana, Kornsorn Srikulnath, 平井啓久, 古賀章彦
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大阪大会
  • 発表場所: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • 年月日: 2014-08-21 – 2014-08-24
• [学会発表] ヨザルの染色体変異に関与したと考えられる大規模反復配列 (2014)
  • 著者名/発表者名: 古賀章彦, Ornjira Prakhongcheep, Nampech Chaiprasertsri, 平井百合子, 平井啓久
  • 学会等名: 第３０回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 大阪科学技術センター（大阪市）
  • 年月日: 2014-07-04 – 2014-07-06