2013 年度研究成果報告書

Long-PCRによる針葉樹葉緑体ゲノム構造の解明とゲノム完全解読システムの構築

研究課題

研究課題/領域番号	25660124
研究種目	挑戦的萌芽研究
配分区分	補助金
研究分野	森林科学
研究機関	九州大学
研究代表者	白石進九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (70226314)
研究分担者	後藤栄治九州大学, 大学院農学研究院, 助教 (90614256)
研究期間 (年度)	2013-04-01 – 2014-03-31
キーワード	葉緑体ゲノム / ゲノム解析 / 針葉樹 / マツ科 / ヒノキ科 / 分子進化
研究概要	針葉樹（Coniferophyta）の葉緑体ゲノムの完全解読のための簡便迅速な分析系の構築を次の２つの方法で行った。1つは，針葉樹葉緑体ゲノムの中で塩基配列が高度に保持されている領域を探索し，それらの配列構造の規則性からLong PCRと次世代シーケンサ（NGS）で解読する方法である。他の方法は，簡単な細胞分画を行い，主に葉緑体DNAが占める画分のDNAを次世代シーケンサで判読し，バイオインフォマティクスを駆使してゲノムを解読する方法である。これら2つの方法により，針葉樹の多くの樹種で，葉緑体ゲノムの完全解読が可能となった。