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2013 年度 実施状況報告書

細胞核内に人為的に作成したアクチン繊維によるエピジェネティック操作基盤の創出

研究課題

研究課題/領域番号 25660286
研究種目

挑戦的萌芽研究

研究機関東北大学

研究代表者

原田 昌彦  東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70218642)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワード細胞核 / アクチン / 遺伝子発現 / クロマチン
研究概要

細胞の発生や分化は、エピジェネティックな制御を受けている。エピジェネティック制御の基盤は、クロマチン構造と、細胞核の構造である。特に最近、細胞核内のアクチン繊維がエピジェネティック制御に関与する可能性が示されている。本研究では、核内のアクチン繊維のエピジェネティック制御を解明し、これを用いて細胞核レベルでの細胞分化や多分化能細胞作製などのエピジェネティックの人為的制御を目的としている。これまでに我々は、核内にアクチン繊維を人為的に形成した細胞の遺伝子発現変化を解析した。その結果、予想よりも多くの遺伝子が、核内のアクチン繊維形成に伴って発現変化を示すことが観察された。特に、遺伝子リプログラミングに中心的な役割を果たすOct4の発現が上昇したことは、今後、核内の人為的なアクチン繊維形成を多分化能細胞作製に利用する上において、大変興味深い。さらに、連携研究者と協力して、核移行シグナルを付加したアクチンを構造的に発現するES細胞の構築を試みた。現在、いくつかのクローンを得ており、これらのクローンにおける核内アクチンの存在、および核内でのアクチン繊維の形成の観察を行っている。さらに、核内のアクチン関連タンパク質をノックダウン、あるいはノックアウトした細胞を解析することにより、これらのアクチン関連タンパク質が細胞核内でのアクチンダイナミクスに関与することを観察した。これまでにも、細胞質ではアクチン関連タンパク質であるArp2/3がアクチン骨格形成の制御を行っていることが報告されていることから、この結果は、細胞核内でのアクチンファミリー間での相互作用によってアクチン機能が制御されていることを示すものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

細胞核内にアクチンを導入してアクチン繊維を形成する実験系を用いることで、核内のアクチン繊維が、遺伝子発現制御において、大きな影響を与えることを確認することができた。とくに、遺伝子リプログラミングに重要な役割を果たすOct4の発現にも核内アクチン繊維が関連していたことから、この結果は、今後の多分化能細胞の作成に核内アクチン繊維を応用する上に置いても重要である。また、これまで核内でのアクチン繊維の形成や解離のメカニズムについては、ほとんどが不明であったが、細胞質だけでなく、細胞核においても、アクチンファミリー間の相互作用がその制御に重要であることを初めてしめすことができた。

今後の研究の推進方策

これまでに作成した実験系を用いて、細胞核内のアクチン繊維が遺伝子発現制御に与える影響について、その分子機構を明らかにする。そのために、アクチンモノマーやアクチン繊維を特異的に検出できるプローブを用いて、細胞染色やクロマチン免疫沈降などを行う。さらに、この細胞に対してiPS細胞作製用のコンストラクトを導入し、iPS細胞形成の効率などを比較解析する。また、核内にアクチン繊維が形成できるES細胞を取得し、このES細胞を用いて、細胞分化や遺伝子発現などを解析する。

次年度の研究費の使用計画

当初は、核内のアクチン繊維形成にともなって発現が変化する遺伝子に着目して、それらの遺伝子の詳細な遺伝子発現変化や、クロマチン免疫沈降によるクロマチンタンパク質やアクチンとの結合を解析する予定であった。しかし、予想よりも多数の遺伝子が核内アクチン繊維によって影響を受けることが明らかとなったため、ここの遺伝子の解析に移行する前に、これらの遺伝子群についてのcDNA取得などを行う必要が生じた。
上記のような、核内のアクチン繊維形成に伴ってその発現が変化する一群の遺伝子の解析を行うための試薬など、消耗品費として、2014年6月ごろまでに次年度使用分を用いる。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 3件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Possible involvement of LKB1-AMPK signaling in non-homologous end joining.2014

    • 著者名/発表者名
      Ui, A., Ogiwara, H., Nakajima, S., Kanno, S., Watanabe, R., Harata, M., Okayama, H., Harris, C.C., Yokota, J., Yasui, A., and Kohno, T.
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 33 ページ: 1640-1648

    • DOI

      10.1038/onc.2013.125

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Improvement of the transformation efficiency of Saccharomyces cerevisiae by altering carbon sources in pre-culture2014

    • 著者名/発表者名
      Konishi, T., et al.
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology and Biochemistry

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reorganization of Damaged Chromatin by the Exchange of Histone Variant H2A.Z-22014

    • 著者名/発表者名
      Nishibuchi, I. et al.
    • 雑誌名

      International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural polymorphism in the L1 loop regions of human H2A.Z.1 and H2A.Z.2.2013

    • 著者名/発表者名
      Horikoshi, N., et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.

      巻: 69 ページ: 2431-2439.

    • DOI

      10.1107/S090744491302252X

    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞分化における核内アクチンの機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      山本浩志
    • 学会等名
      農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      生田
    • 年月日
      20140328-20140330
  • [学会発表] 遺伝子欠損細胞を用いたヒストンバリアントH2A.Zの機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      奥裕行
    • 学会等名
      農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      生田
    • 年月日
      20140328-20140330
  • [学会発表] 転写およびアクチンダイナミクス制御におけるアクチンファミリーArp5, Arp8の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      村上寛和
    • 学会等名
      農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      生田
    • 年月日
      20140328-20140330
  • [学会発表] Roles of actin-related proteins in chromatin function and nuclear organization2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      Annual Meeting, American Society of Cell Biology meeting
    • 発表場所
      New Orleans, USA
    • 年月日
      20131214-20131218
  • [学会発表] ヒトINO80クロマチンリモデリング複合体による遺伝子発現の酸化ストレス応答制御2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      第36回分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] Arp4による核内アクチンダイナミクスとゲノム機能の制御2013

    • 著者名/発表者名
      山崎祥他
    • 学会等名
      第31回 染色体ワークショップ・第12回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      20131125-20131126
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Zアイソフォームの転写制御における機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      日下部将之
    • 学会等名
      第31回 染色体ワークショップ・第12回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      20131125-20131126
  • [学会発表] アクチン・ヒストン両ファミリーによる核・クロマチン機能制御2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      平成25年度遺伝研研究会「クロマチンによる遺伝情報のエピジェネティック制御機構」
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      20131017-20131018
    • 招待講演
  • [学会発表] Contribution of SWR1- and INO80 chromatin remodeling complexes to the spatial positioning of DNA double-strand break.2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      酵母エピジェネティックス国際シンポジウム
    • 発表場所
      福井市
    • 年月日
      20130902-20130904
  • [学会発表] INVOLVEMENT OF THE NUCLEAR ACTIN-RELATED PROTEIN ARP4 IN THE SUBCELLULAR LOCALIZATION AND POLYMERIZATION OF ACTIN2013

    • 著者名/発表者名
      Shota Yamazaki
    • 学会等名
      23rd Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
    • 発表場所
      Debrecen, Hungary
    • 年月日
      20130819-20130824
  • [学会発表] Contribution of histone variant H2A.Z isoforms to transcriptional activation in hyper-acetylated chromatin2013

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Kusakabe
    • 学会等名
      23rd Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
    • 発表場所
      Debrecen, Hungary
    • 年月日
      20130819-20130824
  • [学会発表] Actin family proteins involved in the functional organization of the nucleus2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      23th Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus
    • 発表場所
      Debrecen, Hungary
    • 年月日
      20130819-20130823
    • 招待講演
  • [学会発表] Involvement of nuclear actin- and myosin-families in genome function2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      NIH Tohoku University JSPS Symposium
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20130509-20130511
  • [学会発表] アクチンファミリーによる細胞核・クロマチンの機能構造形成

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会シンポジウム「細胞核内構造体の構築原理と高次生命機能」
    • 発表場所
      横浜
    • 招待講演
  • [学会発表] 転写制御におけるヒストンバリアントH2A.Zアイソフォームの機能解析

    • 著者名/発表者名
      日下部将之
    • 学会等名
      日本生化学会東北支部会第79回例会・シンポジウム
    • 発表場所
      仙台
  • [学会発表] Analyses of human INO80 complex involvement in gene expression regulation under oxidative stress condition

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Takahashi
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
  • [図書] 染色体と細胞核のダイナミクス-DNAを操る細胞の仕組み- 原口徳子・平岡泰編 第11章 核骨格と核タンパク質2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 総ページ数
      236  (169-183)
    • 出版者
      化学同人
  • [図書] ベーシックマスター分子生物学(改訂版) 東中川徹、大山隆、清水光弘編 第8章 翻訳の調節2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 総ページ数
      439 (216-241)
    • 出版者
      オーム社

URL: 

公開日: 2015-05-28  

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