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2014 年度 実績報告書

半導体ナノ加工技術を利用したX線1分子動態計測法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 25670107
研究機関福井大学

研究代表者

清水 啓史  福井大学, 医学部, 講師 (50324158)

研究分担者 平井 義和  京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (40452271)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワード1分子計測 / イオンチャネル
研究実績の概要

本研究では、24 年度に共同利用が始まった京大次世代低炭素ナノハブ創成拠点を利用して、半導体加工技術を応用したX 線1 分子動態計測法の開発(観測プローブ・チャンバー開発)を行った。代表者はX 線1 分子計測法を用いて、イオンチャネル開閉構造変化の1 分子動画計測を行ってきた。この方法では金ナノ結晶を観測プローブとしてイオンチャネル蛋白質に固定し、放射光白色X 線を観測光としてチャネル分子の構造変化を金結晶からの回折点の運動として動画記録する。本研究では、計測法にとって克服すべき課題である、様々なサイズの金ナノ結晶を作製してプローブサイズが蛋白質の運動に与える影響を検証可能にすること、サイズの小さなナノ結晶からの弱い信号でも計測可能なノイズの少ない観測チャンバーの開発を実現することを目的とした。
半導体フォトリソグラフィー技術は、基板上に光硬化するレジストを塗布し、フォトマスクによって光照射範囲を限定することで、任意のパターンを基板上に作製することができる。本研究ではこれを観測プローブである金ナノ結晶の作製およびX線散乱ノイズの少ない観測チャンバー開発に応用した。その結果、数十nmサイズの観測プローブの基板上でのパターンニングに成功し、またマイクロメートルオーダーの溶液層を持つ低ノイズ観測チャンバーの開発が可能であることを見出した。結果をCHEMINAS30および生物物理学会・生理学会に報告した。本挑戦的萌芽研究で明確な研究の端緒を得た本課題はさらなる開発を期して新学術領域研究に採択され、継続されることとなった。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] pH-dependent promotion of phospholipid flip-flop by the KcsA potassium channel2015

    • 著者名/発表者名
      . Nakao, K. Ikeda, M. Iwamoto, H. Shimizu, S. Oiki, Y. Ishihama, M. Nakano
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta-Biomembr

      巻: 1848 ページ: 145-150

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2014.10.001

  • [学会発表] Relationship between Structural Fluctuations and The Opening Conformational Changes of The KcsA Potassium Channel2015

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Shimizu, Masayuki Iwamoto, Yumiko Oota, Shigetoshi Oiki
    • 学会等名
      第120回日本解剖学会総会 全国学術集会, 第92回日本生理学会
    • 発表場所
      神戸国際会議場・展示場
    • 年月日
      2015-03-21 – 2015-03-23
  • [学会発表] The diffracted X-ray tracking method for recording the single-molecule conformational changes of the KcsA potassium channel in a sub-millisecond time resolution2014

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Shimizu, Masayuki Iwamoto, Yumiko Oota, Yoshikazu Hirai, Osamu Tabata, Shigetoshi Oiki
    • 学会等名
      The 45th Natl Inst Physiol Sci (NIPS) International Symposium
    • 発表場所
      Okazaki, Japan
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-28
  • [学会発表] X線1分子動態計測法で用いる低ノイズ観測チャンバーの開発2014

    • 著者名/発表者名
      平井義和、田畑修、清水啓史
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第30回研究会(CHEMINAS30)
    • 発表場所
      北海道大学フロンティア応用化学研究棟
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-03
  • [学会発表] The Enhancement of Structural Fluctuations Prior to The Opening Conformational Changes of The KcsA Potassium Channel2014

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Shimizu, Masayuki Iwamoto, Yumiko Oota, Shigetoshi Oiki
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [学会発表] Development of a method for measuring single-molecule motions of the KcsA potassium channel in a sub-millisecond time resolution2014

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Shimizu, Masayuki Iwamoto, Antoine Royant , David Von Stetten, Laurent Guerin, Michael Wulff , Shigetoshi Oiki
    • 学会等名
      Single Protein Dynamics in Cellulo 2014: Spatio-Temporal, Structural and Quantitative Analyses
    • 発表場所
      OIST seaside house, Okinawa
    • 年月日
      2014-04-21 – 2014-04-25

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公開日: 2016-06-01  

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