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2013 年度 実績報告書

DNAナノ構造体によるナノ粒子超構造の構造制御

研究課題

研究課題/領域番号 25706009
研究種目

若手研究(A)

研究機関名古屋大学

研究代表者

田川 美穂  名古屋大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (40512330)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
キーワードDNA self-assembly / Nanoparticle / Atomic Force Microscopy / Superlattice / ナノ粒子 / 超構造
研究概要

本研究は、DNA分子あるいは数本のDNA分子からなるDNAナノ構造体をガイドとしてナノ粒子を二次元、三次元の秩序的な構造へとプログラマブルにアセンブルし、ナノ粒子超構造を作成することを目的とする。ナノ粒子表面に被覆するDNAの塩基配列、あるいはDNAナノ構造体から生える一本鎖DNAの結合手の塩基配列を変化させることにより粒子間相互作用を制御することが可能であるため、ナノ粒子超構造の構造を制御することができる。具体的には、下記二つの項目を並行で進めた。
(1)結合手を持つDNA正四面体を介在させたDNA被覆ナノ粒子(DNA-NP)の三次元結晶化
(2)基板担持脂質二重膜(SLB)上におけるDNA-NPの二次元結晶化
研究環境の事情によりシンクロトロンX線小角散乱装置が必要な(1)の課題よりも、ラボベースでできる(2)の課題を優先して進めたという点で申請時の実施計画からの変更が生じたが、(2)に関しては当初の計画以上の進度で進めることができた。(1)の三次元結晶化に関しては、DNA-NPと、それに結合する四本の結合手を持ったDNA正四面体が、同程度の大きさのときにダイヤモンド構造となることが確認できている。この構造決定のメカニズムを明らかにするために、本年度はDNA-NPよりも大きいDNA正四面体を介在させた三次元結晶化を行った。この大きいDNA正四面体によりダイヤモンド構造とは別の結晶構造が形成されることは確認されなかったが、ダイヤモンド構造形成にはDNA-NPとDNA正四面体の大きさの比が重要であることが確認できた。
(2)の二次元結晶化に関しては、均一なSLBを製膜する技術、DNA被覆ナノ粒子をSLBに吸着・拡散・二次元結晶化する技術を確立することができた。原子間力顕微鏡測定により、結晶性の良い三角格子の結晶が確認されている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

「ナノ粒子三次元結晶の解析に必要なX線小角散乱装置の使用環境が国内で整わなかったという研究環境の事情により、三次元結晶化の実験よりも二次元結晶化の実験を優先して進めた」という点において申請時の研究計画から変更はあったものの、二次元結晶化に関しては申請時の計画以上に研究が進んだため。

今後の研究の推進方策

三次元結晶化と二次元結晶化を平行して進めるものの、二次元結晶化の研究が予想以上に進展したため、26年度もラボベースで進められる課題2を優先的に進める方針である。
(1)DNA被覆ナノ粒子(DNA-NP)の三次元結晶化
DNA-NPとDNA正四面体の大きさの比を変化させた場合の、出来上がる結晶構造に関し引き続き追求する。大きさの比、等量比を変えてダイヤモンド構造以外の構造が形成されるかどうかを探る。
(2)基板担持脂質二重膜(SLB)上におけるDNA-NPの二次元結晶化
ナノ粒子を被覆するDNAの塩基配列を変化させることでDNA-NP間の相互作用を制御し、二次元結晶の構造制御を行う。二次元結晶の構造解析は、原子間力顕微鏡及び二次元小角散乱により行う。また、SLBの拡散係数の見積もり及びSLB上のDNA-NPの拡散メカニズムを解明し、高品質の二次元結晶化を目指す。

次年度の研究費の使用計画

25年度は大学から配分される女性支援経費を本研究推進のために優先的に充てたため、基金に残額が生じた。
大学から配分される女性支援経費は25年度で終了のため、本年度は本研究費のみで本研究を遂行する必要がある。来年度も基板担持脂質二重膜上におけるDNA被覆ナノ粒子の二次元結晶化を申請時の計画以上に進める予定である。よって、高品質のマイカ基板や脂質の二次元流動性を調べるための蛍光プローブ等の購入額が膨らむ予定であるため、25年度繰り越し分をこれらに充てる。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 2件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Forming two-dimensional structure of DNA-functionalized Au nanoparticles via lipid diffusion in supported lipid bilayers2014

    • 著者名/発表者名
      Takumi Isogai, Agnes Piednoir, Eri Akada, Yuki Akahoshi, Ryugo Tero, Shunta Harada, Toru Ujihara, Miho Tagawa
    • 雑誌名

      Journal of Crystal Growth

      巻: 未定 ページ: 未定

    • DOI

      10.1016/j.jcrysgro.2014.01.032

    • 査読あり
  • [学会発表] 基板担持脂質二重膜を用いたDNA被覆金ナノ粒子の2次元結晶化2014

    • 著者名/発表者名
      磯貝卓巳,赤田英里,Piednoir Agnes,赤星祐樹,手老龍吾,原田俊太,宇治原徹,田川美穂
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年回
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      20140327-20140330
  • [学会発表] Two-dimensional crystallization of DNA-functionalized Au nanoparticles using lipid diffusion2013

    • 著者名/発表者名
      Takumi Isogai, Eri Akada, Agnes Piednoir, Yuki Akahoshi, Ryugo Tero, Shunta Harada, Toru Ujihara, Miho Tagawa
    • 学会等名
      ISETS '13
    • 発表場所
      Nagoya University
    • 年月日
      20131213-20131215
  • [学会発表] DNAと脂質二重膜を用いたナノ粒子の2次元結晶化2013

    • 著者名/発表者名
      磯貝卓巳,赤田英里,Agnes Piednoir,赤星祐樹,手老龍吾,原田俊太,宇治原徹,田川美穂
    • 学会等名
      日本結晶成長学会第43回結晶成長国内会議(NCCG-43)
    • 発表場所
      長野市生涯学習センター (TOiGO内), 長野県
    • 年月日
      20131106-20131108
  • [学会発表] ブラウニアン動力学法を用いた2次元2成分結晶の構造形成シミュレーション2013

    • 著者名/発表者名
      勝野弘康,田川美穂,宇治原徹
    • 学会等名
      日本結晶成長学会第43回結晶成長国内会議(NCCG-43)
    • 発表場所
      長野市生涯学習センター (TOiGO内), 長野県
    • 年月日
      20131106-20131108
  • [学会発表] DNAセルフアセンブリによるナノ粒子超構造制御2013

    • 著者名/発表者名
      田川 美穂, ガング オレグ, 磯貝 卓巳, 赤田 英里, 宇治原 徹
    • 学会等名
      第 51 回日本生物物理学会年会 シンポジウム 反応場デザインによる生命現象の再構成 -創って知る生物物理-
    • 発表場所
      国立京都国際会館, 京都府
    • 年月日
      20131028-20131030
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA-mediated Nanoparticle Assembly2013

    • 著者名/発表者名
      Miho Tagawa, Takumi Isogai, Eri Akada, Shunta Harada, Toru Ujihara
    • 学会等名
      The 2nd International Workshop on Convergence in Condensed Matter and Nano Physics
    • 発表場所
      Sungkyunkwan University, Korea
    • 年月日
      20131007-20131009
    • 招待講演
  • [学会発表] 脂質分子をキャリアとしたDNA被覆金ナノ粒子の2次元結晶化2013

    • 著者名/発表者名
      磯貝卓巳,Agnes Piednoir,赤田英里,赤星祐樹,手老龍吾,原田俊太,宇治原徹,田川美穂
    • 学会等名
      公益社団法人応用物理学会 2013年 第74回応用物理学会秋季学術講演会
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス, 京都府
    • 年月日
      20130916-20130920
  • [学会発表] Forming two-dimensional structure of DNA-functionalized Au nanoparticles via lipid diffusion in supported lipid bilayers2013

    • 著者名/発表者名
      Takumi Isogai, Agnes Piednoir, Eri Akada, Yuki Akahoshi, Ryugo Tero, Shunta Harada, Toru Ujihara, Miho Tagawa
    • 学会等名
      17th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy (ICCGE-17)
    • 発表場所
      University of Warsaw, Warsaw, Poland
    • 年月日
      20130811-20130816
  • [学会発表] Two-dimensional crystallization of DNA-functionalized nanoparticles via lipid diffusion in supported lipid bilayers2013

    • 著者名/発表者名
      Takumi Isogai, Agnes Piednoir, Eri Akada, Yuki Akahoshi, Ryugo Tero, Shunta Harada, Toru Ujihara, Miho Tagawa
    • 学会等名
      15th International Summer School on Crystal Growth(ISSCG-15)
    • 発表場所
      Gdansk University of Technology Gdansk, Poland
    • 年月日
      20130804-20130810
  • [学会発表] Miho Tagawa, Oleg Gang, Kevin Yanger, Takumi Isogai, Eri Akada, Shunta Harada, Toru Ujihara2013

    • 著者名/発表者名
      Nanoparticle Assembly mediated by Designed DNA Nanostructures
    • 学会等名
      Programmable Self-Assembly of Matter Conference 2013
    • 発表場所
      Courant Institute of NYU, New York City, USA
    • 年月日
      20130630-20130702
  • [備考] 名古屋大学工学研究科マテリアル理工学専攻材料工学分野

    • URL

      http://www.numse.nagoya-u.ac.jp/ujihara/

  • [産業財産権] 2次元ナノ粒子構造体及びその製造方法2013

    • 発明者名
      田川美穂、宇治原徹、磯貝卓巳、赤田英里
    • 権利者名
      田川美穂、宇治原徹、磯貝卓巳、赤田英里
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2013-126144
    • 出願年月日
      2013-06-14

URL: 

公開日: 2015-05-28  

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