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2014 年度 実績報告書

気相分光によるペプチド分子の励起状態ダイナミクス―タンパク質の光防御機構

研究課題

研究課題/領域番号 25708001
研究機関東京工業大学

研究代表者

石内 俊一  東京工業大学, 資源化学研究所, 助教 (40338257)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード気相分光 / ペプチド / 励起状態ダイナミクス / レーザー脱離 / レーザー分光
研究実績の概要

25年度に構造を決定したキャップチロシン(Ac-Tyr-NHMe)やチロシンを含むペプチドのS1電子励起状態の寿命測定を行った。前者に関してはシャープ及びブロードな電子スペクトルを与えるコンフォマーが共存することが分かっており、それぞれの寿命を、ピコ秒レーザーによるポンプープローブ法を用いて測定した。その結果、いずれのコンフォマーにおいても1ns程度の寿命であることが分かり、ブロードな電子スペクトルを与えるコンフォマーが特別に短寿命であるということはなかった。この結果から、1)ブロードな電子スペクトルはS1状態での構造変化により多数の振電バンドが立て込んで観測されたためである、2)それぞれのコンフォマーの寿命は発色団であるフェノールの寿命と同等で、ペプチド結合と芳香環の相互作用による短寿命化は起こらない、ということが結論できる。1)に関しては電子スペクトルの計算機シミュレーションでも再現された。また、チロシンのフェノールOH基をHに置換したキャップフェニルアラニンではある特定のコンフォマーでS1状態の短寿命化が報告されており、なぜチロシンでは短寿命化が起こらないのか興味がもたれる。前者の場合、他は数十ナノ秒の寿命であるのに対して、短寿命のコンフォマーでは1nsほどの寿命となっている。この短寿命化は芳香環とペプチド結合との相互作用によるものであるが、それでも1ns程度までしか短寿命化しないことを考えると、チロシンの場合はそもそも発色団であるフェノールの寿命が1nsほどであり、これが律速になっているため、ペプチド結合のとの相互作用による短寿命化が起こっているとしても観測されなかったと考えられる。今後は劇的な短寿命化が期待できるトリプトファンを含むペプチドについて研究を進める予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初、チロシンを含むペプチドでは、ブロードな電子スペクトルを与えるコンフォマーではS1状態の寿命が短いと予想していたが、実際にはどのコンフォマーも同程度の寿命であることが分かり、残念な結果となった。しかし、フェノールOH基がないフェニルアラニンを含むペプチドではS1状態の寿命にコンフォメーション依存性があり、たったフェノールOH基が1つあるかないかでなぜそのような違いがあるのか非常に興味深く、このことが分かったことが大きな進捗であると考えている。

今後の研究の推進方策

トリプトファンではプロトン化するだけでサブピコ秒まで寿命が劇的に短くなることが知られており、チロシンやフェニルアラニンと比べると、コンフォメーションの変化が電子励起状態ダイナミクスにより大きな影響を及ぼすと期待される。これはトリプトファンの発色団であるインドール環ではS1状態とS2状態が接近しており、これらの相互作用の大きさがペプチド結合とインドール環の相互作用により大きく影響を受けるためであると考えられる。これまでの研究で、トリプトファンを含むペプチドのトリプトファンC-末端側の構造により電子スペクトルの様子が大きく異なることが示唆されている。そこで、今後はトリプトファンのC-末端側の配列を系統的に変化させることで、電子スペクトルやS1状態の寿命がどの様に変化するかを調べ、S1状態の寿命とコンフォメーションとの相関に関する規則を見出すことを目指して研究を進める予定である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 5件)

  • [雑誌論文] UV-UV hole burning and IR dip spectroscopy of homophenylalanine by laser desorption supersonic jet technique2014

    • 著者名/発表者名
      Woon Yong Sohn, Shun-ichi Ishiuchi, Pierre Çarçabal, Hikari Oba, Masaaki Fujii
    • 雑誌名

      Chem. Phys.

      巻: 445 ページ: 21-30

    • DOI

      10.1016/j.chemphys.2014.10.012

    • 査読あり
  • [学会発表] Gas phase spectroscopy of soft molecules - neurotransmitters and partial peptide of receptor protein2015

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Ishiuchi
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス
    • 年月日
      2015-03-26
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular flexibility of catecholamine neurotransmitters and relevant molecules studied by laser desorption supersonic jet spectroscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Ishiuchi
    • 学会等名
      Invited Seminar at Gyeongsang National University, Korea
    • 発表場所
      Gyeongsang National University, Korea
    • 年月日
      2015-03-12
    • 招待講演
  • [学会発表] Laser desorption high-pressure supersonic jet spectroscopy of neurotransmission system2015

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Ishiuchi
    • 学会等名
      The 10th Symposium on Gas-phase Laser Spectroscopy and Reaction Dynamics “Structure and Dynamics of Isolated Molecules and Clusters”
    • 発表場所
      Muju Resort (Deogyusan Resort), Korea
    • 年月日
      2015-02-11 – 2015-02-13
    • 招待講演
  • [学会発表] Laser desorption high-pressure supersonic jet spectroscopy of neurotrans- mission system2014

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Ishiuchi
    • 学会等名
      Japan-France Symposium on Biomolecular Structure and Function - Technical Fusion between Spectroscopy and Theory
    • 発表場所
      CEA Saclay, France
    • 年月日
      2014-10-30
    • 招待講演
  • [学会発表] 奨励賞受賞講演「新規レーザー脱離分光法の開発と生体分子の気相分光」2014

    • 著者名/発表者名
      石内俊一
    • 学会等名
      第8回分子科学討論会
    • 発表場所
      広島大学東広島キャンパス
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-24
    • 招待講演
  • [学会発表] Gas-phase spectroscopy of small peptides - conformation vs excited state dynamics2014

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Ishiuchi, Woon Yong Sohn, Masaaki Fujii
    • 学会等名
      ibbi14 (Conference on Isolated Biomolecules and Bimolecular Interactions, 2014)
    • 発表場所
      Porquerolles, France
    • 年月日
      2014-05-18 – 2014-05-23
  • [学会発表] Molecular flexibility of catecholamine neurotransmitters and relevant molecules studied by laser desorption supersonic jet spectroscopy2014

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Ishiuchi, Taichi Warashina, Woon Yong Sohn, Masaaki Fujii
    • 学会等名
      Gordon Research Conference "Molecular and Ionic Clusters 2014)
    • 発表場所
      Renaissance Tuscany Il Ciocco Resort in Lucca (Barga) Italy
    • 年月日
      2014-04-27 – 2014-05-02

URL: 

公開日: 2016-06-01  

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