セパレースの自己切断はセパレースの急激な活性化に必要だが、自己切断が積極的にセパレースを活性化するのではなく、自己切断によって抑制因子のサイクリンB1が結合しやすくなり、染色体分離直前まで厳格な抑制が維持されやすくなっていた。このセパレース活性の抑制が維持できなくなるという現象はがん細胞でひろく見られ、分裂期の長さとの関連が見出された。正常二倍体細胞において人為的に分裂期を長くすると、セパレース活性の抑制が維持できなくなり染色体分離異常が頻発することから、がん細胞で頻発する染色体分離異常も染色体分離開始の遅延とそれにともなうセパレース活性化異常が原因のひとつとなっている可能性がある。
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