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2014 年度 実績報告書

寄生性高等植物における寄生の分子メカニズム解明

研究課題

研究課題/領域番号 25711019
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

吉田 聡子  独立行政法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (20450421)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
キーワード寄生植物 / ゲノム / 変異体 / 遺伝学
研究実績の概要

1. マーカー遺伝子を用いた変異体の表現型解析
得られた変異体について、マーカー遺伝子を用いて表現型を解析した。寄生時に発現する遺伝子の、変異体での発現パターンを調べた。また、表現型に応じて、寄生マーカー遺伝子や細胞分裂、導管形成、植物ホルモン応答マーカーなどのプロモーター::GFPコンストラクト作成し、形質転換することにより、変異体内でのマーカー遺伝子の挙動を追った。
2. コシオガマ遺伝地図作成と原因遺伝子同定法の確立
変異体単離の野生株として用いた生態型Okayama(岡山大学、榎本先生より寄贈)と比較的早咲きでOkayamaとのSNPsが確認されているKyushu(九州大学、矢原先生より寄贈)ラインをかけ合わせ、F2世代を用いてマーカー解析をした。表現型が最も明確に確認できる変異体を用いて、原因遺伝子の同定をおこなった。得られた変異体を野生型親株にかけ合わせ、表現型のあるF2世代植物DNAのプールをシーケンスするMutMap法(Abe et al. 2012, Nature Biotech. 30, 174-178)を用いて、シーケンスをおこなった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

変異体のスクリーニングを終了し、その表現型解析を進めている。また、遺伝子同定のためのシーケンスをおこない、候補遺伝子を得た。当初の予定通り順調に進展していると考えている。

今後の研究の推進方策

変異体原因遺伝子の同定をすすめ、その遺伝子機能解析をおこなう。また、他の変異体についても同定をすすめる。また、表現型解析の結果を論文として発表する。

次年度使用額が生じた理由

研究員の雇用が当初予定より半年遅れてスタートしたため、人件費を次年度に繰り越しする。

次年度使用額の使用計画

引き続き研究員の雇用をおこない、研究を推進する。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち謝辞記載あり 2件、 査読あり 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Transcriptomics exposes the uniqueness of parasitic plants2015

    • 著者名/発表者名
      Ichihashi, Y., Mutuku, J. M., Yoshida, S. and Shirasu, K.
    • 雑誌名

      Brief. Func. Genomics

      巻: 0 ページ: 0

    • DOI

      doi: 10.1093/bfgp/elv001

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 遺伝子から見た根寄生植物の生存戦略2014

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子、若竹崇雅、白須賢
    • 雑誌名

      植物の生長調節

      巻: 49 ページ: 66-73

    • 謝辞記載あり
  • [学会発表] 寄生植物ストライガの感染戦略と宿主植物の応答2015

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      シンポジウム「寄生・共生インシデント」
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2015-04-28
    • 招待講演
  • [学会発表] 寄生植物ストライガの抵抗性におけるジャスモン酸とサリチル酸シグナル経路の役割2015

    • 著者名/発表者名
      Musembi Mutuku、吉田聡子、清水崇史、市橋泰範、高橋章、瀬尾光範、白須賢
    • 学会等名
      日本植物病理学会
    • 発表場所
      明治大学
    • 年月日
      2015-03-28 – 2015-03-31
  • [学会発表] 寄生植物と宿主植物の細胞壁をめぐる攻防2015

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子, Musembi Mutuku, Songkui Cui, 堀千明, 清水崇, 市橋安範, 出村拓, 白須賢
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東京農業大学
    • 年月日
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [学会発表] Molecular and genomic analyses of the witchweed Striga2014

    • 著者名/発表者名
      Satoko Yoshida
    • 学会等名
      筑波大学 Global Science week
    • 発表場所
      筑波大学
    • 年月日
      2014-09-29
    • 招待講演
  • [学会発表] 寄生植物ストライガの全ゲノム解読2014

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子, Thomas Spallek, Songkui Cui, 市橋 泰範, Seungill Kim, Yong-Min Kim, 真鍋 理一郎, Michael Timko, Doil Choi, 白須 賢
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス
    • 年月日
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [学会発表] ゲノム・トランスクリプトーム解析からみた植物の寄生2014

    • 著者名/発表者名
      吉田聡子
    • 学会等名
      第8回細菌学若手コロッセウム
    • 発表場所
      ニセコ
    • 年月日
      2014-08-07
    • 招待講演

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公開日: 2016-06-01  

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