統合ゲノム解析によるパーキンソン病の遺伝子同定と個別化医療開発

2014 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 25713015
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 佐竹 渉 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50467594)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: エクソーム / パーキンソン病 / 孤発性神経疾患 / 神経内科学 / 人類遺伝学 / 神経遺伝

研究実績の概要

申請者らは、主要な神経難病 パーキンソン病（PD）のゲノムワイド関連解析を行い、本症を引き起こす4つの遺伝子リスクを同定、世界に先駆けて発表した（Satake W et al, Nature Genetics 2009）。本申請ではこの研究を格段に進展、さらなるPD遺伝子発見のため、次世代シークエンサーのゲノム解読能を本症に応用する。特に、エクソンに存在する、疾患への効果サイズの大きいRare variantリスクに焦点をあて、孤発性PDの全エクソン塩基配列を解読。全エクソン家系解析・全エクソン関連解析を行い、孤発性PDのRare variantリスクを発見する。本年度はさらに患者検体の解読をすすめ、患者群におおい、一塩基の変化を抽出することができた。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

計画通り進んでいるため

今後の研究の推進方策

家族歴のあるパーキンソン病患者の全エクソン解読を行い、塩基配列を決定。孤発性のデータと合わせて、パーキンソン病遺伝子をさらに発見する。

次年度使用額が生じた理由

検体の準備日程との関係で、実験試薬の使用量が減ったため。

次年度使用額の使用計画

今後の検体準備に伴い、実験を遂行するので、それに使用する。

研究成果

• [雑誌論文] ABCG2 variant has opposing effects on onset ages of Parkinson's disease and gout. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, Tomiyama H, Satake W, Chiba T, Onoue H, Kawamura Y, Nakayama A, Shimizu S, Sakiyama M, Funayama M, Nishioka K, Shimizu T, Kaida K, Kamakura K, Toda T, Hattori N, Shinomiya N.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol 巻: 2 ページ: 302-306
  • DOI: 10.1002/acn3.167
  • 査読あり
• [雑誌論文] CHCHD2 mutations in autosomal dominant late-onset Parkinson's disease: a genome-wide linkage and sequencing study (2015)
  • 著者名/発表者名: Funayama M, Ohe K, Amo T, Furuya N, Yamaguchi J, Saiki S, Li Y, Ogaki K, Ando M, Yoshino H, Tomiyama H, Nishioka K, Hasegawa K, Saiki H, Satake W, Mogushi K, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Toda T, Mizuno Y, Uchiyama Y, Ohno K, Hattori N.
  • 雑誌名: Lancet Neurol 巻: 14 ページ: 274-282
  • DOI: 10.1016/S1474-4422(14)70266-2
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel calmodulin mutations associated with congenital arrhythmia susceptibility (2014)
  • 著者名/発表者名: Makita N, Yagihara N, Crotti L, Johnson CN, Beckmann BM, Roh MS, Shigemizu D, Lichtner P, Ishikawa T, Aiba T, Homfray T, Behr ER, Klug D, Denjoy I, Mastantuono E, Theisen D, Tsunoda T,Satake W, Toda T, Nakagawa H, (16名省略), Watanabe H, Chazin WJ, George AL Jr.
  • 雑誌名: Circ Cardiovasc Genet 巻: 7 ページ: 466-474
  • DOI: 10.1161/CIRCGENETICS.113.000459
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A case of Bardet-Biedl syndrome complicated with intracranial hypertension in a Japanese child (2014)
  • 著者名/発表者名: Saida K, Inaba Y, Hirano M, Satake W, Toda T, Suzuki Y, Sudo A, Noda S, Hidaka Y, Hirabayashi K, Imai H, Kurokawa T, Koike K.
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 36 ページ: 721-724
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2013.10.013
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 孤発性パーキンソン病のエクソーム関連解析と第2期SNP-GWAS (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉、重水大智、鈴木穣 、山本健、富山弘幸、高橋篤、村田美穂、服部信孝、田中敏博 、角田達彦 、久保充明、辻省次、松本直通 、菅野純夫、戸田 達史
  • 学会等名: 日本人類伝学会第59回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-20 – 2014-11-22
• [学会発表] Risk genes and genome research of sporadic Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Toda T
  • 学会等名: The 20th International Congress of Personalized Medicine
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2014-11-15 – 2014-11-15
  • 招待講演
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Shigemizu D, Suzuki Y, Yamamoto K, Tomiyama H, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Tsunoda T, Kubo M, Tsuji S, Nakamura Y, Sugano S, Toda T.
  • 学会等名: American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: San Diego
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson’s disease (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Hasegawa K, Murata M, Hattori N, Toda T.
  • 学会等名: Genetic Epidemiology of Parkinson's disease Annual meeting
  • 発表場所: Vancouver
  • 年月日: 2014-09-10 – 2014-09-12
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Ando Y, Tomiyama H, Kashihara K, Mochizuki H, Murayama S, Takeda A, Hasegawa K, Tsuji S, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T.
  • 学会等名: The MDS 18th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: Stockholm
  • 年月日: 2014-06-08 – 2014-06-12
• [学会発表] パーキンソン病感受性遺伝子α-synuiclein SNPとnoncoding RNA (2014)
  • 著者名/発表者名: 水田依久子、佐竹渉、村山繁雄、金川基、小林千浩、高藤和輝、永森収志、山本光利、服部信孝、村田美穂、金井好克、水野敏樹、中川正法、戸田達史
  • 学会等名: 第55回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2014-05-21 – 2014-05-24