統合ゲノム解析によるパーキンソン病の遺伝子同定と個別化医療開発

2015 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 25713015
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 佐竹 渉 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50467594)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: パーキンソン病

研究実績の概要

申請者らは、主要な神経難病であるパーキンソン病のゲノムワイド関連解析を行い、本症を引き起こす4つの遺伝子リスクを同定、世界に先駆けて発表した(Satake W et al, Nature Genet 2009)。本申請ではこの研究を格段に進展、さらなるパーキンソン病遺伝子発見のため、次世代シークエンサーのゲノム解読能を本症に応用する。特にエクソンに存在する、疾患への効果サイズの大きいrare variantリスクに焦点をあて、孤発性パーキンソン病の全エクソン塩基配列を解読。全エクソン関連解析をこない、孤発性パーキンソン病のrare variantリスクを発見する。
パーキンソン病1400例の全エクソーム解読を行い、非患者群データと比較、関連検定を行うことにより、疾患効果サイズの大きい、パーキンソン病リスクの候補variantを同定できた。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の予定どおり進んでいるため。

今後の研究の推進方策

追加実験を行い、結果をまとめて成果発表をする。

次年度使用額が生じた理由

追加実験の必要が生じたため。またそれら結果をまとめて成果発表をするため。

次年度使用額の使用計画

遺伝学的、分子生物学的解析を行い、成果発表を行う。

研究成果

• [雑誌論文] A novel PIGN mutation and prenatal diagnosis of inherited glycosylphosphatidylinositol deficiency. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Taniguchi-Ikeda M, Murakami Y, Nakamura S, Motooka D, Emoto T, Satake W, Nishiyama M, Toyoshima D, Morisada N, Takada S, Tairaku S, Okamoto N, Morioka I, Kurahashi H, Toda T, Kinoshita T, Iijima K.
  • 雑誌名: Am J Med Genet A. 巻: 170A ページ: 183-188
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.37397.
  • 査読あり
• [雑誌論文] ABCG2 variant has opposing effects on onset ages of Parkinson's disease and gout. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, Tomiyama H, Satake W, Chiba T, Onoue H, Kawamura Y, Nakayama A, Shimizu S, Sakiyama M, Funayama M, Nishioka K, Shimizu T, Kaida K, Kamakura K, Toda T, Hattori N, Shinomiya N.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol 巻: 2 ページ: 302-306
  • DOI: 10.1002/acn3.167
  • 査読あり
• [雑誌論文] Variants associated with Gaucher disease in multiple system atrophy. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T,,(51名略), Satake W, (14名略),, Tsuji S.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol 巻: 2 ページ: 417-426
  • DOI: 10.1002/acn3.185.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] CHCHD2 mutations in autosomal dominant late-onset Parkinson's disease: a genome-wide linkage and sequencing study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Funayama M, Ohe K, Amo T, Furuya N, Yamaguchi J, Saiki S, Li Y, Ogaki K, Ando M, Yoshino H, Tomiyama H, Nishioka K, Hasegawa K, Saiki H, Satake W, Mogushi K, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Toda T, Mizuno Y, Uchiyama Y, Ohno K, Hattori N.
  • 雑誌名: Lancet Neurol 巻: 14 ページ: 274-282
  • DOI: 10.1016/S1474-4422(14)70266-2.
  • 査読あり
• [雑誌論文] The First Nationwide Survey and Genetic Analyses of Bardet-Biedl Syndrome in Japan. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirano M, Satake W, Ihara K, Tsuge I, Kondo S, Saida K, Betsui H, Okubo K, Sakamoto H, Ueno S, Ikuno Y, Ishihara R, Iwahashi H, Ohishi M, Mano T, Yamashita T, Suzuki Y, Nakamura Y, Kusunoki S, Toda T.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: e0136317
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0136317.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Exome Analyses of Long QT Syndrome Reveal Candidate Pathogenic Mutations in Calmodulin-Interacting Genes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu D, Aiba T, Nakagawa H, Ozaki K, Miya F, Satake W, Toda T, Miyamoto Y, Fujimoto A, Suzuki Y, Kubo M, Tsunoda T, Shimizu W, Tanaka T.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: e0130329
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0130329
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A de novo mutation of the MYH7 gene in a large Chinese family with autosomal dominant myopathy. (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda T, Xiong H, Kobayashi K, Wang S, Satake W, Jiao H, Yang Y, Cha PC, Hayashi YK, Nishino I, Suzuki Y, Sugano S, Wu X, Toda T.
  • 雑誌名: Hum Genome Var 巻: 16 ページ: 15022
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.22
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] パーキンソン病のゲノム解析研究 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉
  • 学会等名: ニューロサイエンスネットワーク
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2016-03-18 – 2016-03-18
• [学会発表] Genomic study and subsequent in silico drug discovery for Parkinson’s disease (2016)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Uenaka T, Cha PC, Okada Y, Kashihara K, Murayama S, Hasegawa K, Mochizuki H, Takeda A, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T
  • 学会等名: 5th Asian and Oceanian Parkinson’s Disease and Movement Disorders Congress
  • 発表場所: Manila
  • 年月日: 2016-03-11 – 2016-03-13
  • 国際学会
• [学会発表] Next step of GWAS and Exome study for Parkinson’s disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Takeda A, Mochizuki H, Hasegawa K, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, Toda T
  • 学会等名: 10th Annual Meeting Genetic Epidemiology of Parkinson's disease
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-10-01 – 2015-10-02
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Genome-wide association study (GWAS) in neurodegenerative disorders (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W
  • 学会等名: International Parkinson and Movement Disorder Society Basic Summer School
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-08-06 – 2015-08-08
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Japanese Parkinson's disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Ando Y, Suzuki M, Tomiyama H, Nagai Y, Kashihara K, Murayama S, Mochizuki H, Nakashima K, Hasegawa K, Takeda A, Wada K, Tsuji S, Yamamoto M, Murata M, Hattori N, and Toda T.
  • 学会等名: 19th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: San Diego
  • 年月日: 2015-06-14 – 2015-06-18
  • 国際学会
• [学会発表] Exome Association Study and 2nd SNP-GWAS of Parkinson's disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W， Ando Y， Suzuki M， Tomiyama H， Nagai Y， Murayama S， Mochizuki H， Nakashima K， Obata F， Hasegawa K， Takeda A， Wada K， Tsuji S， Yamamoto M， Murata M， Hattori N， Toda T
  • 学会等名: 第56回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 2015-05-20 – 2015-05-23
• [学会発表] Exome Association study and SNP-GWAS of Parkinson’s disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Satake W, Suzuki Y, Shigemizu D, Cha PC, Tsuji S, Tsunoda T, Kubo M, Sugano S, Matsumoto N, Toda T
  • 学会等名: The 11th International workshop on Advanced Genomics; 国際ゲノム会議
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-05-20 – 2015-05-22
  • 国際学会 / 招待講演