研究課題
近年、ゲノムDNA中に存在が確認された5-ヒドロキシメチル化シトシン(5-hydroxymethyl C: 5hmC)は、5-メチル化シトシン(5-methyl C: 5mC)の酸化産物であり、DNA脱メチル化反応における中間代謝産物であることから「第6番目の塩基」として注目されている。本研究は、メチル化異常に起因する小児のインプリンティング異常症において、ヒドロキシメチル化が病態にどのように関与しているかを解明することが目的である。本年度は、代表的なインプリンティング異常疾患である鏡ー緒方症候群(KOS)症例を集積し、ゲノムワイドな5hmCの分布の解明を行った。従来からメチル化解析で頻用されているバイサルファイト法では5mCと5hmCを区別することができないことから、これを改変した酸化バイサルファイト法を用い、これとパイロシークエンス、サブクローニングおよびDNAメチル化ビーズアレイを組み合わせ、5mCおよび5hmCの分布を1塩基レベルで解析し報告した(Matsubara et al. Clin Epigenetics 2015、研究代表者山澤が最終・責任著者)。これは世界で初めてのヒトインプリンティング異常症における5hmCに関する報告である。この報告によってKOS症例における5mCおよび5hmCの分布が明らかとなり、また脳サンプルでの解析が重要であることが示され、さらに本解析法の有用性が証明された。
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)
国立医療学会誌
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Clinical Epigenetics
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