| 研究課題/領域番号 |
25850021
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| 研究機関 | 香川大学 |
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研究代表者 |
鳴海 貴子 香川大学, 農学部, 准教授 (30469829)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2018-03-31
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| キーワード | 花弁表皮細胞 / トレニア / 転写因子 |
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| 研究実績の概要 |
これまでの研究から、TfMYBML2およびTfMYBML3が花弁表皮細胞の形の制御に関与する転写因子であるが、それらが花弁表皮細胞の形の制御の関わる主因子ではないことが明らかになっている。そこで、本年度は新規の花弁表皮細胞関連転写因子の探索を行うため、野生型トレニアと花弁表皮細胞が変化しているTCP3-SRDX形質転換体トレニア由来のRNA-seqデータから、顕著な遺伝子発現量の差を示すTCP転写因子およびMYB転写因子とアノテーションされた配列を抽出した。TCP3-SRDX形質転換体と野生型の比較でfold changeが2倍以上の配列は、TCP転写因子が3個、MYB転写因子が19個、fold changeが0.5倍以下の配列は、TCP転写因子が9個、MYB転写因子が50個であった。TCP転写因子がMYB転写因子を制御している事が多いため、TCP転写因子に着目した。RNA-seq解析データを元にプライマーを設計し遺伝子単離を試みた結果、fold changeが3倍以上の配列由来の遺伝子が2種類(TfTCP7およびTfTCP10)、fold changeが0.2倍の配列由来の遺伝子が1種類(TfTCP8)単離された。推定アミノ酸配列を解析したところ、いずれもTCP転写因子の保存領域を有し、TfTCP7およびTfTCP8はClass I TCPファミリーに特有のアミノ酸配列を、TfTCP10はClass II TCPファミリーのCINグループ特有のアミノ酸配列をコードしていた。Class II TCPファミリーのCINグループには、葉や花弁の表皮細胞の形態を制御する転写因子が属しているため、単離したTfTCP10は表皮細胞の形態制御に関わる転写因子であることが示唆された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本年度は新規の花弁表皮細胞関連転写因子の探索を行うため、野生型トレニアと花弁表皮細胞が変化しているTCP3-SRDX形質転換体トレニア由来のRNA-seqデータから、顕著な遺伝子発現量の差を示す転写因子を抽出し、遺伝子単離まで行うことができた。なお、計画では差次的遺伝子発現解析として、サブトラクション法やディファレンシャルディスプレイ法を当初は予定していたが、トレニアのRNA-seqデータが存在するため、そのデータを利用した。
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| 今後の研究の推進方策 |
単離した遺伝子のうち一種類が表皮細胞の形態に関わる転写因子の可能性が高いため、今後、遺伝子発現解析等を行う予定である。また、MYB転写因子にも着目し、野生型とTCP3-SRDX形質転換体で遺伝子発現量に差がある遺伝子を抽出し、遺伝子単離を進める予定である。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
本年度は、研究の基礎を固めることに注力したため、研究の進捗としては概ね計画道理には進んでいるが、学会発表できるようなデータが得られなかった。
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| 次年度使用額の使用計画 |
次年度は、研究のみならず、学会発表や論文投稿を予定している。
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